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标题: 求助gromacs中如何等距地从轨迹中抽取帧 [打印本页]

作者
Author: zhangzh 时间: 2020-7-17 15:11
标题: 求助gromacs中如何等距地从轨迹中抽取帧
我用pull命令得到一对分子沿直线运动的轨迹后，如何从中抽出质心距离相等的帧？有没有快速一点的方法或小工具呢

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-18 10:44
如果你是指等间距来抽，自己写个VMD tcl脚本完成。循环所有帧，根据距离条件writepdb存出来结构就完了。没有比这更简单的方法

作者
Author: zhangzh 时间: 2020-7-18 11:01

sobereva 发表于 2020-7-18 10:44
如果你是指等间距来抽，自己写个VMD tcl脚本完成。循环所有帧，根据距离条件writepdb存出来结构就完了。没 ...

谢谢老师，那请问伞形采样是否一定需要每个窗口都是等距离的呢？

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