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标题: vasp在运行，但输出数据不更新 [打印本页]

作者
Author: wowowo324 时间: 2020-7-17 15:29
标题: vasp在运行，但输出数据不更新
在计算大体系结构优化时和做分子动力学模拟时，vasp在正常运行，但输出数据更新一段时间后就不再更新，任务也没有停止。请问这是什么原因呢？

作者
Author: zblxyrz 时间: 2020-7-17 21:15
同问，我也这样

作者
Author: wypkdhd 时间: 2020-7-17 22:51
top查看系统占用率，尤其是cpu占用率，如果占用率没掉。那么有两种情况。
第一种：我在vasp5.2.2上见到过这样的情况，是系统的原因。
第二种：我在5.4.4上遇到过，是编译器的原因，编译器版本不对造成内存溢出。

作者
Author: wowowo324 时间: 2020-7-20 08:35
你好。请问占用率没掉是什么意思？我是5.4.4版本，如果是编译器的问题，要怎么解决呢？重新安装吗？谢谢。

作者
Author: wowowo324 时间: 2020-7-20 10:51

wypkdhd 发表于 2020-7-17 22:51
top查看系统占用率，尤其是cpu占用率，如果占用率没掉。那么有两种情况。
第一种：我在vasp5.2.2上见到过 ...

你好。请问占用率没掉是什么意思？我是5.4.4版本，如果是编译器的问题，要怎么解决呢？重新安装吗？谢谢。

作者
Author: wypkdhd 时间: 2020-7-20 16:32

wowowo324 发表于 2020-7-20 10:51
你好。请问占用率没掉是什么意思？我是5.4.4版本，如果是编译器的问题，要怎么解决呢？重新安装吗？谢谢 ...

top 里面cpu占用率没掉。

作者
Author: wypkdhd 时间: 2020-7-20 16:33

wowowo324 发表于 2020-7-20 10:51
你好。请问占用率没掉是什么意思？我是5.4.4版本，如果是编译器的问题，要怎么解决呢？重新安装吗？谢谢 ...

解决办法可以看我已发的帖子。

作者
Author: wowowo324 时间: 2020-7-21 10:15

wypkdhd 发表于 2020-7-20 16:33
解决办法可以看我已发的帖子。

好的，谢谢！

作者
Author: wowowo324 时间: 2020-8-10 10:38

wypkdhd 发表于 2020-7-20 16:33
解决办法可以看我已发的帖子。

你好，我按照您的帖子上的方法把编译器更换成Update1了，vasp也重新安装了，但跑了几个任务后又出现了数据不更新的问题。也不报错。这还有什么办法解决吗? 谢谢！

作者
Author: wypkdhd 时间: 2020-8-10 10:55

wowowo324 发表于 2020-8-10 10:38
你好，我按照您的帖子上的方法把编译器更换成Update1了，vasp也重新安装了，但跑了几个任务后又出现了数 ...

你是否注意了里面的第七步

作者
Author: wypkdhd 时间: 2020-8-10 10:55
(7)2020.2.16 2020.3.31补链接为了解决mpi的问题，我们选择安装intel mpi2015，VASP用2019编译安装完之后，只需要再安装mpi2015，不需要更改其他，把mpi安装目录下的profile.d目录中的相应的.sh加入bashrc中。
采用soft-hpc安装，这个软件包不好找，已上传百度云。也可在VASPKIT FAQs 群号331895604或理论计算化学研习社群号905699144中@本人，随时会在群文件中补链接。
链接：https://pan.baidu.com/s/1wciADZwM3bUudbJ_f917_g
提取码：wd7x
2020.2.23 经过一周测试，采用mpi2015后，一切正常，内存缓存buffer等可正常释放。

作者
Author: wypkdhd 时间: 2020-8-10 10:55

wowowo324 发表于 2020-8-10 10:38
你好，我按照您的帖子上的方法把编译器更换成Update1了，vasp也重新安装了，但跑了几个任务后又出现了数 ...

(7)2020.2.16 2020.3.31补链接为了解决mpi的问题，我们选择安装intel mpi2015，VASP用2019编译安装完之后，只需要再安装mpi2015，不需要更改其他，把mpi安装目录下的profile.d目录中的相应的.sh加入bashrc中。
采用soft-hpc安装，这个软件包不好找，已上传百度云。也可在VASPKIT FAQs 群号331895604或理论计算化学研习社群号905699144中@本人，随时会在群文件中补链接。
链接：https://pan.baidu.com/s/1wciADZwM3bUudbJ_f917_g
提取码：wd7x
2020.2.23 经过一周测试，采用mpi2015后，一切正常，内存缓存buffer等可正常释放。

作者
Author: wowowo324 时间: 2020-8-13 10:57

wypkdhd 发表于 2020-8-10 10:55
(7)2020.2.16 2020.3.31补链接为了解决mpi的问题，我们选择安装intel mpi2015，VASP用2019编译安装完之 ...

由于是初学者，很多都不是很懂。我们已经安装了mpi2019update1，然后再直接安装mpi2015吗？还是只安装mpi2015才可能解决这个问题？
我在VASPKIT FAQs的群文件里搜了soft-hpc，但没有找到。如果可以，您能再分享一下吗？
谢谢。

作者
Author: wypkdhd 时间: 2020-8-14 21:45

wowowo324 发表于 2020-8-13 10:57
由于是初学者，很多都不是很懂。我们已经安装了mpi2019update1，然后再直接安装mpi2015吗？还是只安装mpi ...

教程写的很详细，再直接安装mpi2015即可，群里已经上传，可直接搜索。

作者
Author: wowowo324 时间: 2020-8-17 10:33

wypkdhd 发表于 2020-8-14 21:45
教程写的很详细，再直接安装mpi2015即可，群里已经上传，可直接搜索。

多谢。

作者
Author: qiugejiaocheng 时间: 2021-11-8 09:15
我的vasp5.4.4也出现了这个问题，用nohup mpirun -np xx vasp > vasp.out &就可以了；xx指分配的CPU核数。

作者
Author: scl 时间: 2025-8-26 20:15

wowowo324 发表于 2020-8-17 10:33
多谢。

你好，请问你的vasp运行的问题解决了吗，我想求个mpi2015

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