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标题: 如何得到分子动力学模拟中结构变化及键长 [打印本页]

作者
Author: sdjgdu 时间: 2020-7-18 15:28
标题: 如何得到分子动力学模拟中结构变化及键长
如何得到下图中分子动力学模拟中不同时间所对应的结构变化，以及如何得到不同时间某个键长的变化。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-18 19:12
叠加图的绘制：
绘制范德华势论文中动力学模拟过程中原子位置叠加图的做法介绍
http://bbs.keinsci.com/thread-17446-1-1.html

下面附件里是我下面这篇文章中获得上面键长变化数据用的VMD脚本，载入轨迹后执行
一篇最全面、系统的研究新颖独特的18碳环的理论文章
http://sobereva.com/524（http://bbs.keinsci.com/thread-15792-1-1.html）
(, 下载次数 Times of downloads: 178)

作者
Author: sdjgdu 时间: 2020-7-18 20:07
感谢sobereva社长的热心回复！

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