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标题: 用Multiwfn分析跨桥/跨空间电荷转移(TB/TSCT)的思路和脚本:tstb [打印本页]

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ggdh    时间: 2020-7-22 16:15
标题: 用Multiwfn分析跨桥/跨空间电荷转移(TB/TSCT)的思路和脚本:tstb
本帖最后由 ggdh 于 2020-7-22 18:34 编辑

0. 前言
跨空间电荷转移的体系比较典型的一个模式图如下图所示
D和A分别是电子给体和受体。他们都连接在桥上,同时他们在空间上也靠近。
于是一个自然而然的的问题就是:
分子发生CT吸收或者发射时,有多少电荷是跨空间转移(TSCT)的,有多少电荷是跨桥转移(TBCT)的?
这个问题其实是个概念问题,实验上没法表征出来的。好在我们有万能的Multiwfn,可以玩一些骚操作。
于是我就用Multiwfn做了相应的分析,没想到文章发表之后有n个人问我怎么操作的(夸张),今天看到论坛还有人在发帖问。
我就把我的操作和思路分享在这里,对应的脚本也放在这。希望有兴趣的各路大神批评指正。
(, 下载次数 Times of downloads: 112)
1. 分析思路
我认为这个TSCT,TBCT的的概念有两种:
a.分子到激发态后,电子是如何发生转移的?
电子转移的非驰豫部分,可以对应到Multiwfn 得到的空穴电子分布。
如果是这种概念的CT,那么我们可以在Multiwfn中通过IFCT方法计算电子激发过程中任意片段间的电子转移量来进行分析
其中D-A的之间直接发生电荷转移可以看作是跨空间的,通过而D-ππ-A发生的电荷转移可以看成是跨桥的。
b.贡献了CT态的吸收或者发射的那部分电子在哪里
如果一个分子的空穴和电子没有空间重叠,即使电子转移程度很大,可是该跃迁禁阻,无法被观察到。
换句话说,这部分的电子转移对光的吸收或者发射没有贡献。
这时候我关心的就是CT跃迁当中,对发光/吸收有贡献的那部分电子是分布在D-A之间的空间中,还是分布在D-A之间的桥上。
可以通过考察a)跃迁密度或者b)空穴电子重叠的分布来判断TS/TB的比例。
我采取的做法是:
1)计算完整分子的跃迁密度/空穴电子重叠(Sr),该部分为TS+TB之和(计算跃迁密度的方法是用Multiwfn得到该cube,然后对该cube取绝对值,然后积分)
2)然后删掉中间的π桥的波函数,重新计算,得到纯TS部分
3)1的结果减去2的结果得到纯TB的部分
当时我选择的就是这种方法,因为我考虑到一个CT态之所以能被观察到(有发射吸收),就是因为空穴电子的重叠,不然的话,叫它PET态也许更合适?

总结一下,目前算TS/TB有3种方法:
1)计算IFCT
2)计算跃迁密度的分布
3)计算空穴电子重叠的分布
我写了一个脚本能分别用上面三种方法进行分析。

2. 脚本操作说明
运行条件:a) Linux系统,或者WSL中运行windows版Multiwfn。b) 确保Multiwfn,或者Multiwfn.exe 在你的系统路径中
1.把脚本加入路径当中,并用chmod+x增加可执行权限
2.找到给体,受体,以及桥连基团片段的编号,可以参考这个视频利用gview方便地提取选定区域的原子序号
3.在激发态计算的fchk和log文件的目录下输入(里面的原子编号是虚指):
  1. tstb -m td -n 1 -g 3 -d 1-6 -a 10-16 -b 7-9,17-24 XXX.fchk XXX.log
复制代码
然后等待Multiwfn分析,如果正确运行,屏幕上最后会给出分析结果(具体形式见第三部分的例子)
下面是选项的说明:
-m    选项选分析方法,默认的是td(基于跃迁密度的分析),还可以选he(基于空穴电子重叠的分析),ifct(基于片段间电荷转移的分析)
-n     选激发态的序号,默认是1
-g     选Multiwfn产生cube时用的格点,默认是3
-b     设定桥连片段的原子编号(这个没有默认,必须设)
-d     设定给体片段的原子编号(只有用ifct方法时才设)
-a     设定受体片段的原子编号(只有用ifct方法时才需要设)

3.示例
我对两个体系做了分析,结果如下:
(, 下载次数 Times of downloads: 136)
结构图中红色的是受体,蓝色的是给体,黑色的是桥。
我把左边的例子的fchk文件和log文件放在附件中 (, 下载次数 Times of downloads: 243) (, 下载次数 Times of downloads: 164) ,有兴趣的同学可以尝试
下面是具体的命令:

  1. tstb -m td  -n 5 -b 1-8,10-13,33-39 -d 9,14-32,40-49,51-52 -a  53-74,76-90 DM-B.fchk DM-B.log
复制代码
如果需要算空穴电子重叠,或者IFCT,修改-m选项参数为he或者ifct就行。
这里-n 5的意思是因为我算的时候用了td(50-50), 结果前4个态都是三重态,第五个态才是S1态。


4.问题
下面谈谈这个方法的一些问题(要是没有问题,我就投Nature了),使用时务必注意:
1. 用td或者he方法时,对给体和受体上有LE成分的激发态不合适,因为LE部分会被判断为through space部分。当D和A面对面靠近时,给体上的hole和受体上的electron发生重叠的区域就在D和A之上,这和DA之上的LE态是无法区分的。

重要!如何判断LE态是否会干扰分析
观察hole和electron的分布,如果hole在受体上没有分布,并且electron在给体上没有分布。那就可以判断LE态没有干扰。一般要实现这个条件通常需要D或者A有一方和Bridge打断共轭(通过SP3碳、90度二面角、或者轨道对称性不匹配)
2. 桥的指定可能比较随意。比如上面示例中左边体系中的那个螺原子,可以划分给D,也可划分给桥。
3. 体系中存在D-B 和B-A的跃迁(B就是指bridge),在td/he方法中,这部分跃迁全部归属于TB部分。但在ifct方法中,假设D-B转移了0.4个电子,B-A转移了0.2个电子,那么through bridge转移的电子只算做0.2个,而剩下的0.2个D-B的电荷转移不考虑。这也就是上面右边那个例子中,用td/he方法得到的TS成分比ifct得到的TS成分要小不少的原因。这是这个体系中有比较明显的D-B转移,而B-A的转移很弱,这部分D-B电荷转移在td/he中被划分到TB部分了,而在ifct方法中这部分没有划分到TB部分,导致ifct中TB成分很小(如果是完整的从D到A的电荷转移,总转移量应该是1,但是注意到上图右边例子中,总转移量只有0.55。这说明很多电子不是从D到A的转移,而是转移到桥上了,或者是从桥转移出来了)


P.S. 本脚本也可以作为一个普通的IFCT分析的wrapper(虽然比直接用Multiwfn没方便多少。。)脚本没有处理IFCT的结果。但是Multiwfn的分析结果会在屏幕上打印出来,比如下图:
(, 下载次数 Times of downloads: 127)
其中片段1就是donor,片段2是bridge,片段3是acceptor











作者
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winnerwill    时间: 2020-7-23 03:39
本帖最后由 winnerwill 于 2020-7-23 04:53 编辑

谢谢分享!

有几个问题请教:
一是,跃迁密度和空穴电子方法刚好比例一致,是否说明了什么?
二是,无桥键接(D和A直接相连)的情形是否能综合这几种方法来一起细分呢?
另外,LE干扰的问题是否其实无法避免?毕竟以上都是考虑了净电荷量。
作者
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ggdh    时间: 2020-7-23 09:05
本帖最后由 ggdh 于 2020-7-23 09:06 编辑
winnerwill 发表于 2020-7-23 03:39
谢谢分享!

有几个问题请教:

1,跃迁密度是先乘在取绝对值。空穴电子重叠是先取绝对值再乘,所以大概就是一样的?我没研究数学上是否正好等价,所以这个还有待测试不同的体系看是否都一样。。
2,无桥连接,DA如果共轭,肯定会有LE态干扰,另外如果不共轭,也难以实现“面对面”的排列,好像必须得有个桥才能实现空间作用?你能否举出DA直接连接并且有空间作用的例子?
3. 严格的说LE是无法避免的,其实,只要DA有相互作用,无论是直接共轭,还是空间作用。都会导致hole“入侵”到受体,而electron“入侵”到给体上,只要这种情况一出现。那就意味着LE成分的出现。而完全没有相互作用(hole-electron完全没有空间重叠)的态,必然就是个完全暗态(没有吸收发射),所以,可以说LE成分赋予了态的光明和意义(能被观测到)。所以TS/TB的问题换个说法就是空穴电子重叠产生的LE成分是因为空间作用产生的,还是因为通过sigma键连接产生的。
作者
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冰释之川    时间: 2020-7-23 10:08
昨天看到TSCT和TBCT的概念,没想到今天就有计算教程了
作者
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小范范1989    时间: 2020-7-23 17:11
当时看文章的时候,一猜就是钟老师团队做的计算。
作者
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winnerwill    时间: 2020-7-23 19:09
ggdh 发表于 2020-7-23 09:05
1,跃迁密度是先乘在取绝对值。空穴电子重叠是先取绝对值再乘,所以大概就是一样的?我没研究数学上是否 ...

无桥连接,比如左边示例,比如把原来做法中的桥并到Donor unit部分。
作者
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winnerwill    时间: 2020-7-23 19:11
本帖最后由 winnerwill 于 2020-7-23 19:49 编辑
winnerwill 发表于 2020-7-23 19:09
无桥连接,比如左边示例,比如把原来做法中的桥并到Donor unit部分。

算出来的结果是:
TS/TB using transition density:
Through Space CT: 0.22860    95.96%
Through Bond  CT: 0.00961    4.03%
Tot transit dens: 0.23821

TS/TB using hole-electron overlap:
Through Space CT: 0.15936    95.96%
Through Bond  CT: 0.00670    4.03%
Tot h-e  overlap: 0.16606

TS/TB using IFCT:
Through Space CT: 0.93847    99.74%
Through Bond  CT: 0.00244    0.25%
Tot Charge Trans: 0.94091
按理说桥并到Donor之后,Acceptor所得到的TB部分不应该是比例增加的吗?前面两种比例的变化却不是这样。而这IFCT 给出的比例显然更不合理解。

作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-23 19:14
另外,在这个例子里,前面两种方法中的总的绝对值的比例始终保持为:1.43448。是不是这个数值也有点某个规律的系数的味道
作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-23 19:30
本帖最后由 winnerwill 于 2020-7-23 20:05 编辑

发现把桥B并入D部分之后,重新理解IFCT的做法,按理说(D+B)——>A过程中A所发生的净转移量应该是一致的吧,但实际上发现并桥后的Net 2->3是没并桥前的Net1-2和Net2->3的差值,这个是否有问题?
原先做法:
Transferred electrons between fragments:
  1 ->  2:   0.03110       1 <-  2:   0.00053     Net  1 ->  2:   0.03057
  1 ->  3:   0.90666       1 <-  3:   0.00021     Net  1 ->  3:   0.90646
  2 ->  3:   0.03244       2 <-  3:   0.00044     Net  2 ->  3:   0.03201


桥B并入D部分后:
Transferred electrons between fragments:
  1 ->  2:   0.12158       1 <-  2:   0.00021     Net  1 ->  2:   0.12137
  1 ->  3:   0.93911       1 <-  3:   0.00064     Net  1 ->  3:   0.93847
  2 ->  3:   0.00408       2 <-  3:   0.00164     Net  2 ->  3:   0.00244


并前的Net1->3和Net2->3之和为并之后的Net1->3,这个应该就是Acceptor Unit所得到的净转移量,这样看来,这个净转移量是综合了TS和TB之和。也就是此时IFCT方法无法区分开这两种,给出的比例不对

作者
Author:
ggdh    时间: 2020-7-23 22:38
winnerwill 发表于 2020-7-23 19:11
算出来的结果是:
TS/TB using transition density:
Through Space CT: 0.22860    95.96%

这个脚本的原理是你必须指定Bridge,或者是“Bond”,它就会算Through Bond CT
如果你把桥并到Donor之后,那你把什么部分指定为桥了呢?-b选项怎么选的?
我猜你是把连接D和A的那个σ键对应的两个原子设为桥。
结果就是桥变得比之前小多了,所以计算得到的TB的成分就会变小。
想想也合理啊,以前是阳关道,现在是独木桥,TB的成分变少不奇怪啊。。。
IFCT也是一样。
IFCT中的TB就是往桥上转移的和从桥上转出的电子。
现在桥变小了,往桥上转移的和从桥上转出的电子都会变少。TB自然就变少了。

作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-23 23:30
ggdh 发表于 2020-7-23 22:38
这个脚本的原理是你必须指定Bridge,或者是“Bond”,它就会算Through Bond CT
如果你把桥并到Donor之后 ...

感觉这个桥的选定会造成结果很不一样。实际上,我之前用您的那个脚本算无桥连接,桥接原子是选sigma键的两个原子为桥。这两个原子归或者不归原来的D或A计算,结果一样。我的意思是IFCT结果里面,0.93847是个总的量(最大值)。
B桥单独分出来处理,D->A 的转移量应该是没有合起来(D+B)->A的净转移量大的吧?
作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-23 23:33
ggdh 发表于 2020-7-23 22:38
这个脚本的原理是你必须指定Bridge,或者是“Bond”,它就会算Through Bond CT
如果你把桥并到Donor之后 ...

而且通常您示例左边的结构更倾向于把螺芴和三苯胺的整体结果做为一个Donor Unit来处理,其实就是我所理解的很多无桥连接的一种
作者
Author:
ggdh    时间: 2020-7-23 23:39
winnerwill 发表于 2020-7-23 23:30
感觉这个桥的选定会造成结果很不一样。实际上,我之前用您的那个脚本算无桥连接,桥接原子是选sigma键的 ...

电荷转移的总量应该是1
但是我gjf中没有设IOp(9/40=4)
导致一些轨道的贡献没有考虑进去

不一定,可能某些情况下A->B的转移比B->A的转移大,这时候(D+B)-> A的转移反而会变小

螺芴和三苯胺的整体结果做为一个Donor Unit来处理,这个做法不太化学
因为他们不共轭。空穴,或者HOMO也没有在螺芴上有分布。。



作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-23 23:41
比如把桥选为芴中与Acceptor相连的苯环,那么算出来的,除了Acceptor之外的其他部分向Acceptor的总净转移也是0.93847。


Transferred electrons between fragments:
  1 ->  2:   0.03012       1 <-  2:   0.00027     Net  1 ->  2:   0.02985
  1 ->  3:   0.92419       1 <-  3:   0.00023     Net  1 ->  3:   0.92396
  2 ->  3:   0.01492       2 <-  3:   0.00041     Net  2 ->  3:   0.01450
TS/TB using IFCT:
Through Space CT: 0.92396    98.45%
Through Bond  CT: 0.01450    1.54%
Tot Charge Trans: 0.93846


作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-23 23:48
总转移量是在输出结果中这里体现的吧?
Variation of population number of fragment  3:   0.93847
作者
Author:
ggdh    时间: 2020-7-23 23:54
本帖最后由 ggdh 于 2020-7-23 23:55 编辑
winnerwill 发表于 2020-7-23 23:48
总转移量是在输出结果中这里体现的吧?
Variation of population number of fragment  3:   0.93847

这个是D->A的以及D->B->A的,B的净得失没有体现在这里面
作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-24 07:34
ggdh 发表于 2020-7-23 22:38
这个脚本的原理是你必须指定Bridge,或者是“Bond”,它就会算Through Bond CT
如果你把桥并到Donor之后 ...

这个sigma键是TB的必经之路,正是独木桥,是D到A的TBCT的唯一通道,不经过它都不算TB了。螺芴的其他部分对TB来说也许就是个停车场的作用
作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-24 07:37
所以我觉得相对于其他两种方法,IFCT要么多到的都是TB,要么是TB和TS两者之和但无法区分
作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-24 07:40
ggdh 发表于 2020-7-23 23:39
电荷转移的总量应该是1
但是我gjf中没有设IOp(9/40=4)
导致一些轨道的贡献没有考虑进去

真正的桥,就应该是连接的键。如果D-B-A是个平面性很好的共轭分子,那怎么选桥?
作者
Author:
ggdh    时间: 2020-7-24 10:27
本帖最后由 ggdh 于 2020-7-24 10:37 编辑
winnerwill 发表于 2020-7-24 07:40
真正的桥,就应该是连接的键。如果D-B-A是个平面性很好的共轭分子,那怎么选桥?

TBCT这个概念从字面意思上来说是,当分子被激发时,电荷从D经过B,转移到A。
但实际上,桥的作用不是这个
之前提到,电子要从D转移到A,只要DA靠近,就能发生电子转移,不一定要经过桥。
但是要想观察到吸收发射。那就必须有空穴电子的重叠。(重叠不是充分条件,因为还要考虑对称性,但是是必要条件)
因此,如果讨论吸收发射,桥的功能可以有3个
1.分别和D和A共轭,使得DA轨道通过桥发生相互作用。从而使得空穴电子能在D和A上发生重叠
2.空穴电子在桥上发生重叠。(这就是我这里所谓的TBCT)
3.固定DA空间位置,使他们空间靠近,从而在空间上发生耦合,从而使得空穴电子能在D和A上发生重叠(这就是这里所谓的TSCT)
当分子是一个DBA平面性很好的分子。主要是1,2 作用。这时候基本不存在3作用。但是我们可以通过这个脚本把12作用分开。看看可以玩个什么概念,比如这时候我们可以把HLCT中的LE成分划分为:2作用是BPLE(Bridge Produced Local Excited),1作用是BILE(Bridge Induced Local Excited)。。。。。
作者
Author:
haikuotiankong    时间: 2020-7-24 16:09
https://www.nature.com/articles/s41563-020-0710-z

Highly efficient luminescence from space-confined charge-transfer emitters

Nature Materials (2020)
作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-24 16:53
haikuotiankong 发表于 2020-7-24 16:09
https://www.nature.com/articles/s41563-020-0710-z

Highly efficient luminescence from space-confi ...

这个也是钟老师的大作。里面的IFCT也是净转移量,无法区分TB和TS
作者
Author:
winnerwill    时间: 2020-7-24 16:56
ggdh 发表于 2020-7-24 10:27
TBCT这个概念从字面意思上来说是,当分子被激发时,电荷从D经过B,转移到A。
但实际上,桥的作用不是这 ...

同意桥可以这么选定,但是IFCT确实无法区分TS和TB,否则直接相连的部分都是得算为TB,那么显然比例跟其他两种方法计算的TS远大于TB就相矛盾了
作者
Author:
ggdh    时间: 2020-7-24 19:35
本帖最后由 ggdh 于 2020-7-24 19:40 编辑
winnerwill 发表于 2020-7-24 16:56
同意桥可以这么选定,但是IFCT确实无法区分TS和TB,否则直接相连的部分都是得算为TB,那么显然比例跟其他 ...

虽然原理不同
IFCT是基于空穴电子的分布(以及激发态对应的轨道组成)做的分析
he/td方法是基于空穴电子重叠的分布做的分析。
但我想了想,得到的结果出现很大差异的可能性不大。
he/td方法中,想要TB部分大,就需要空穴电子在Bridge上重叠大。
重叠大,就意味着空穴电子分布多。
而如果Bridge上空穴,电子分布多。那多半意味着在IFCT中分析中:
D->B 大(B上电子分布大)
B->A 大 (B上空穴分布大)
我在脚本中,IFCT判断TB的成分是min(D->B,B->A)
作者
Author:
TZL    时间: 2021-4-1 10:48
请问右边的分子是哪篇文献的?没有搜到
作者
Author:
桌坛新星10500    时间: 2021-7-5 11:30
TZL 发表于 2021-4-1 10:48
请问右边的分子是哪篇文献的?没有搜到

是杨楚罗课题组的Achieving 21% External Quantum Efficiency for Nondoped
Solution-Processed Sky-Blue Thermally Activated Delayed
Fluorescence OLEDs by Means of Multi-(Donor/Acceptor)
Emitter with Through-Space/-Bond Charge Transfer
作者
Author:
桌坛新星10500    时间: 2021-7-6 11:29
我进入这个领域不久,想请教一下老师:(1)WSL中运行windows版Multiwfn是什么意思?(2)怎样在Windows版Multiwfn中将脚本可执行化?十分感谢。
作者
Author:
ggdh    时间: 2021-7-10 15:15
桌坛新星10500 发表于 2021-7-6 11:29
我进入这个领域不久,想请教一下老师:(1)WSL中运行windows版Multiwfn是什么意思?(2)怎样在Windows版M ...

1) wsl 是linux系统,但是里面也能运行windows程序,比如Multiwfn.exe
2) 这个脚本没法在纯window下运行,必须有linux环境,
还有问题可以加我QQ 32589927
作者
Author:
桌坛新星10500    时间: 2021-7-15 16:19
ggdh 发表于 2021-7-10 15:15
1) wsl 是linux系统,但是里面也能运行windows程序,比如Multiwfn.exe
2) 这个脚本没法在纯window下运行 ...

谢谢钟老师,经过几天的调试还是报错,老师我加您一下QQ,给您添麻烦了。
作者
Author:
kay    时间: 2021-10-21 17:49
钟老师,请教个问题,除了上述您说的构型之外,像D-A-D型的分子,在两个相同的D之间能否会出现TSCT?通过您的方法我计算了两个D-A-D型的分子,把A认为是桥,两个相同的D分别作为一个D和一个A,能计算出50-60%左右的TSCT,不知道这个数据是否准确?

作者
Author:
ggdh    时间: 2021-10-22 13:39
kay 发表于 2021-10-21 17:49
钟老师,请教个问题,除了上述您说的构型之外,像D-A-D型的分子,在两个相同的D之间能否会出现TSCT?通过您 ...

你这个体系电子不会出现在Donor上,不适合用此方法。你如果想判断两个D片段之间的作用 可以用IGM,或者是看他们之间的轨道重叠程度。
作者
Author:
偶遇龙猫    时间: 2021-12-26 10:50
老师您好,看了您的这个方法我进行了我的计算,计算跃迁密度的分布和空穴电子重叠分布时都可以计算出结果,但是计算IFCT时没有结果,不知道什么原因(刚学计算)。IFCT的计算如图
作者
Author:
浅宇涵    时间: 2022-5-20 09:31
想请教一下各位老师,如果受体是一个溴原子,可不可以用这种方法进行计算,如果可以该用哪种分析方法?(本人是一个小菜鸟,表述可能不准确,请各位老师批评指正。)
作者
Author:
ggdh    时间: 2022-5-23 11:43
浅宇涵 发表于 2022-5-20 09:31
想请教一下各位老师,如果受体是一个溴原子,可不可以用这种方法进行计算,如果可以该用哪种分析方法?(本 ...

Br不太可能是一个受体把 你确定你的LUMO 在Br原子上?或者是激发态对应的空穴电子分布中 电子在Br上?

作者
Author:
浅宇涵    时间: 2022-5-23 19:27
ggdh 发表于 2022-5-23 11:43
Br不太可能是一个受体把 你确定你的LUMO 在Br原子上?或者是激发态对应的空穴电子分布中 电子在Br上?

(, 下载次数 Times of downloads: 81) 老师,是这样的一个分子,蓝色部分是供体,上半部分除溴原子之外是桥,想请教一下这样一个分子怎么算空间电荷转移的比例。

作者
Author:
ggdh    时间: 2022-5-24 17:44
浅宇涵 发表于 2022-5-23 19:27
老师,是这样的一个分子,蓝色部分是供体,上半部分除溴原子之外是桥,想请教一下这样一个分子怎么算空间 ...

正常算就行
估计你这里面Br原子上的电子分布会很少
所以TSCT的成分会很低
大部分是到桥上了
作者
Author:
浅宇涵    时间: 2022-5-25 08:15
ggdh 发表于 2022-5-24 17:44
正常算就行
估计你这里面Br原子上的电子分布会很少
所以TSCT的成分会很低

好的,明白啦,谢谢老师。
作者
Author:
酸甜小柠檬    时间: 2022-5-25 09:32
ggdh 发表于 2022-5-24 17:44
正常算就行
估计你这里面Br原子上的电子分布会很少
所以TSCT的成分会很低

老师,请教一下,如果一个分子的供受体是一样的,可以使用这种方法近行计算吗?
作者
Author:
ggdh    时间: 2022-5-27 00:40
酸甜小柠檬 发表于 2022-5-25 09:32
老师,请教一下,如果一个分子的供受体是一样的,可以使用这种方法近行计算吗?

可以的, 只要空穴和电子能够因为某种原因分别出现在供体和受体上

作者
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酸甜小柠檬    时间: 2022-5-29 18:21
ggdh 发表于 2022-5-27 00:40
可以的, 只要空穴和电子能够因为某种原因分别出现在供体和受体上

哦哦 好的 谢谢老师
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虎王    时间: 2022-6-16 16:00
ggdh 发表于 2020-7-23 09:05
1,跃迁密度是先乘在取绝对值。空穴电子重叠是先取绝对值再乘,所以大概就是一样的?我没研究数学上是否 ...

那个,“在取绝对值”的“在”是“再”。
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虎王    时间: 2022-6-16 16:01
小范范1989 发表于 2020-7-23 17:11
当时看文章的时候,一猜就是钟老师团队做的计算。

没写作者姓名吗?
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小范范1989    时间: 2022-6-17 08:32
虎王 发表于 2022-6-16 16:01
没写作者姓名吗?

当时我记得第一次看的时候(你懂的),通讯是杨老师,实验为主,后面看到了钟老师的名字,所以当时就知道,这里面的计算肯定是钟老师做的。

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虎王    时间: 2022-6-17 15:49
小范范1989 发表于 2022-6-17 08:32
当时我记得第一次看的时候(你懂的),通讯是杨老师,实验为主,后面看到了钟老师的名字,所以当时 ...

那确实呀!
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guodx    时间: 2022-12-6 21:24
老师好,我是一个菜鸟,请问您在1分析思路中b)具体做法的第二步提到的删掉中间的Π桥波函数是什么意思呢?谢谢指教
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人心向背    时间: 2023-7-23 14:17
老师好,我在利用您的脚本计算两个TSCT的分子的跨桥/跨空间电荷转移(TB/TSCT)的比例时,(蓝色是供体,红色是受体,黑色是桥),通过td和he 方法计算的TSCT比例超过100%,两种方法的计算结果相同,下面是td的结果。请问为什么会出现这种情况呢?
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人心向背    时间: 2023-7-23 14:18
两个分子s1的NTO如下
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ggdh    时间: 2023-7-29 10:31
人心向背 发表于 2023-7-23 14:17
老师好,我在利用您的脚本计算两个TSCT的分子的跨桥/跨空间电荷转移(TB/TSCT)的比例时,(蓝色是供体,红色 ...

你着两个都是td方法啊,没看到你用he方法。
另外 td方法里面不应该出现负值。
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人心向背    时间: 2023-7-31 12:11
ggdh 发表于 2023-7-29 10:31
你着两个都是td方法啊,没看到你用he方法。
另外 td方法里面不应该出现负值。

he的结果和td的一样,就没摆出来,我也好奇为啥会算出来负值,会不会是受体基团氧原子的影响
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limalvis    时间: 2023-9-19 17:04
感谢钟老师,又多了一个可以写进去分析的点




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