计算化学公社

标题: 求助：MCPB.py构建模型的问题 [打印本页]

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作者
Author: caroline    时间: 2020-7-23 10:06
标题: 求助：MCPB.py构建模型的问题
各位分子模拟的大神：
我是分子模拟的初学者。最近做用AMBER20带的MCPB.py构建一个含铁的金属酶的模型，用于后续MD模拟等工作的开展。在执行mcpb的时候报了如下错误，不知该如何解决，Traceback (most recent call last):
  File "/home-ys/users/YS_yangyf/jly/Softwares/Amber/amber20/bin/MCPB.py", line 578, in <module>
    addbpairs)
  File "/home-ys/users/YS_yangyf/jly/Softwares/Amber/amber20/lib/python3.7/site-packages/pymsmt/mcpb/gene_model_files.py", line 51, in get_ms_resnames
    resid = mol.atoms.resid
KeyError: 7440
恳请各位大神指教，谢谢！！

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作者
Author: chenjinfeng850    时间: 2020-7-23 20:46
看起来像是残基名称的问题，检查一下你输入结构的残基名称是否有误

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作者
Author: caroline    时间: 2020-7-25 10:26

chenjinfeng850 发表于 2020-7-23 20:46
看起来像是残基名称的问题，检查一下你输入结构的残基名称是否有误

谢谢，已解决！

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