计算化学公社

标题: 求助 gromacs 计算improper dihedral [打印本页]

作者
Author: 北京的大猫 时间: 2020-7-24 10:22
标题: 求助 gromacs 计算improper dihedral
各位前辈大家好！
我想用gmx angle 计算体系内的improper dihedral 项，看过sob老师的回复（http://bbs.keinsci.com/thread-14410-1-1.html），知道如何计算正常的dihedral ,
但是不知道计算improper时该怎么书写index文件内的原子顺序，比如1-2-3-4组成的improper,1是中心原子，想计算4与平面123的角度，该怎么书写顺序呢？

谢谢各位老师！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)