计算化学公社

标题: 8173M or 8175M [打印本页]
作者
Author: damao4361556    时间: 2020-7-27 17:45
标题: 8173M or 8175M
本帖最后由 damao4361556 于 2020-7-27 17:47 编辑

代理商报价，提供的配置清单说 并行计算要求CPU是6的倍数，且 主频和核心数8173M：2.0X28=56，8175M：2.5X24=60
因而代理商说 8175比8173性能好

纠结选哪个。。。

谢谢






作者
Author: monoyu    时间: 2020-7-27 20:47
1.性能不是你那么算的吧，看CPU频率也要看满载时的全核睿频，没有看默频的。
2.配置单里的三块硬盘看不太明白，其实参考社长贴中的顶级配置即可。
3.这报价坑你1w。
作者
Author: abin    时间: 2020-7-27 22:05
三硬盘方案，是鄙人推荐的。

另，全程CPU密集型计算，还能指望全核心睿频？
能100%保证标称频率就不错了。

如果主要面向单机计算。
推荐24核心，而非28核心。
如果你用vasp，
你晓得根据不同计算规模而设定
注入NCORE，NPAR，KPAR数值、
你可以发现，28核心因为存在7这个因子，
在某些计算阶段，有部分核心处于等待状态。

24核心，最小可以划分为六个一组，
是偶数个核心。
配合MPI+openMP方案，可能有额外15%的性能提升。

如果对于上面提到的bands 划分没有任何概念，
请忽略以上信息。
作者
Author: abin    时间: 2020-7-27 22:07
价格没啥纠结的，
看钱下单呗。

要想知道哪一个好，对比测试一下就行。
作者
Author: qinzhong605    时间: 2020-7-27 22:29
半斤八两的性能，哪个便宜要哪个。还有，参考社长硬件的那个帖子，别被坑那么多钱。
作者
Author: abin    时间: 2020-7-27 23:10
关于通过合理调整
NCORE KPAR NPAR
最大化优化VASP并行效率， 可以参考这里提到的视频： https://www.bilibili.com/video/BV1DK411J7tN/

如果不仅仅是一台机器，建议做集群来计算。
硬盘的钱，可以置换为万兆网卡和线缆(两台机器不用交换机)。
可以参考这个视频里的内容：https://www.bilibili.com/video/BV1eg4y1v7HM

多说一句，
三硬盘方案，先后有两次，在不同的平台，受邀做经验分享，
我有提过这个方案。

最先提供的是，1TB HDD做系统； 4 x 1TB RAID0读写加速；4TB HDD做数据。当时，SDD比较贵，1TB HDD大概300元不到。

后来，推荐采用120GB SDD SATA接口做系统，因为便宜，大概100元。
NVME硬盘价格也开始降低，所以推荐采用1TB做读写，可以根据实际需要更换容量。

所有方案中，均是推荐数据硬盘，采用独立的硬盘来处理。

这种方案有如下的好处，
1  不用花太多的钱，可以取得更好的性能和安全性，包括抵御脑残操作删除数据，或者重装系统时候抹掉数据。
2  如果在系统构建之处，额外多话了120元，对系统盘做DD备份，一旦发现系统因为误操作而挂了，那么直接更换系统盘就可以工作。
如果你的硬件服务商，不是本地的，如果系统出现因为自己操作失误导致无法启动之类的，商家几乎不可能上门维修的。

当然，如果认为，任何时候，硬盘对于自己的计算没有任何影响，
所有的机器配置中，直接用HDD就行了。

另外，固态硬盘的另一个有点是，不怕突发停电；相反，机械硬盘，如果会遭遇频繁的突发停电事故，要当心你的数据哦。
作者
Author: damao4361556    时间: 2020-7-28 00:26
abin 发表于 2020-7-27 23:10
关于通过合理调整
NCORE KPAR NPAR
最大化优化VASP并行效率， 可以参考这里提到的视频： https://www.bil ...

谢谢您详细的解答
作者
Author: sobereva    时间: 2020-7-28 06:34
“并行计算要求CPU是6的倍数”根本没这回事，完全是奇谈怪论，除非特殊应用场合。居然卖服务器的人能说出这样的话，真行，若不是不懂，就是刻意坑你
另外，问配置的时候应当说清楚平时主要都跑什么程序。诸如跑动力学，用固态没意义。

2*8175M性能高过2*8173M这是毫无疑问的

用三硬盘完全没必要。系统装机械上就完了，240G固态完全是个鸡肋。

报价明显太高了。对比http://sobereva.com/444文章便知


作者
Author: abin    时间: 2020-7-28 09:11
本帖最后由 abin 于 2020-7-28 10:51 编辑

你看看，
说什么来什么？
看图片。
如果遭遇突发断电， 机械硬盘可能出现故障。
当然问题很简单，扫描硬盘维护一下就可以了。

但是对于装系统都不会的，做磁盘扫描维护肯定很难。
(, 下载次数 Times of downloads: 73)


不过对于当前的案列，首先BIOS设定时间，而后扫描磁盘就解决了。

如果这里提到的方案，
你都不会，
那么如果当初有dd了系统硬盘，直接换一下硬盘就可以了。 大概耗时10分钟就搞定了。

补充一下：
在机器维护的角度讲，
如果系统盘是独立的而且有备份，那么更换系统盘，(开机箱，拔掉硬盘，接上新硬盘)，大概4分钟，
注意，由于数据和系统是独立硬盘，那么开机后，系统直接可用。

如果是一个硬盘，所有都在一起。
万一某一天出现如上的故障，
你自己又不会弄，找一个本地上门维修的，出场费至少200元起价吧？
修机器的估计只管装系统，至于软件，数据，你自己弄吧。
这个场景熟悉吧？

而采用额外的独立系统盘，资费可能多300元，可以避免将来不必要的麻烦。

当然，机器未必就那么倒霉，会坏掉。
作者
Author: damao4361556    时间: 2020-7-28 11:07
sobereva 发表于 2020-7-28 06:34
“并行计算要求CPU是6的倍数”根本没这回事，完全是奇谈怪论，除非特殊应用场合。居然卖服务器的人能说出这 ...

卢老师，服务器厂商推荐了8179M，这个相对于8173M 8175M 价格更低 性能更好。。。
因而，8179M性价比更高？
作者
Author: monoyu    时间: 2020-7-28 11:33
damao4361556 发表于 2020-7-28 11:07
卢老师，服务器厂商推荐了8179M，这个相对于8173M 8175M 价格更低 性能更好。。。
因而，8179M性价比更 ...

8179M会更便宜么？不会是拿8179M的正显跟8175M的正式去比较的吧
作者
Author: damao4361556    时间: 2020-7-28 14:55
monoyu 发表于 2020-7-28 11:33
8179M会更便宜么？不会是拿8179M的正显跟8175M的正式去比较的吧

8179m 正式版的  卢老师推荐的那个淘宝卖家
作者
Author: ChemG    时间: 2020-7-28 15:40
damao4361556 发表于 2020-7-28 14:55
8179m 正式版的  卢老师推荐的那个淘宝卖家

专门跟他说的要8175M么，我们也想买一台呢，不知道有没有必要将8173M换为8175M.想按sob老师推荐的顶配整一台
作者
Author: abin    时间: 2020-7-28 16:29
作为旁观者，
建议选择超微主板。
一般这个主板，默认带有IPMI接口，
配置了之后，通过一根网线可以做所有事情了，
包括但不限于，开机，关机，重启，进入BIOS，重装系统等。
如果你对于机器的管理维护，还停留在，接鼠标、键盘、显示器去看看的阶段，
你可以尝试使用一下这个方案。

某些主板也叫做BMC。

其他主板也有该功能，但是默认需要额外购买模块来实现哦。
作者
Author: sobereva    时间: 2020-7-29 03:18
damao4361556 发表于 2020-7-28 14:55
8179m 正式版的  卢老师推荐的那个淘宝卖家

8179M价格合适的话可以买
作者
Author: damao4361556    时间: 2020-7-29 08:54
本帖最后由 damao4361556 于 2020-7-29 09:04 编辑
sobereva 发表于 2020-7-29 03:18
8179M价格合适的话可以买

8179M 卖家报价4500左右。基于2颗 8179M的机器，一套下来 26000左右。。。。
卖家说的是 8179M 正式版



作者
Author: akang    时间: 2020-7-29 10:25
damao4361556 发表于 2020-7-28 14:55
8179m 正式版的  卢老师推荐的那个淘宝卖家

我也是看了推荐去询问的那家，那家TB卖家产品写的库存有货，想下单一问没货。不知道是因为做不成生意了，还是就是这么厉害您问问题爱答不理的，消息看完也不回复。
作者
Author: damao4361556    时间: 2020-7-29 11:17
akang 发表于 2020-7-29 10:25
我也是看了推荐去询问的那家，那家TB卖家产品写的库存有货，想下单一问没货。不知道是因为做不成生意了， ...

你问的是哪家淘宝店啊
作者
Author: akang    时间: 2020-7-29 14:37
damao4361556 发表于 2020-7-29 11:17
你问的是哪家淘宝店啊

嘉*科技
作者
Author: qinzhong605    时间: 2020-7-29 14:46
服务态度的确不怎么样，哈哈。
作者
Author: abin    时间: 2020-7-30 21:37
一个组装服务器的商家，能对于VASP并行，用24核心和28核心处理器，
讲出来6的倍数之类的话，应该是看过关于VASP并行效率的资料的。
不过他可能无法准确描述，为何24核心28核心处理器最比较的时候，6的倍数之类的多重要，
然后表述的语句可能有歧义。

做一个分析。
首先说明，如果你用VASP，但是对于以下提到的概念没有任何概念，那你就慢慢算吧，没必要去研究如何算的快，
反正算的慢，就有更多的时间来划水了。

VASP的并行分好几个维度，
想要更深入了解，自己看手册好了。

假定一个计算中，指定完基组后，VASP报告NBANDS 180个，也许和你自己数的不同，但是程序一般会弄成偶数个。

想算的快呢，合理划分一下并行设定呗。

如果是双路24核心，合计有48个核心。
180 bands，分4组，每一个组有45bands，每一个band用12个核心计算。
完成一组计算，先后跑三个12核心，再跑1个9核心，那么某个时间段内，空闲3个核心。

如果是双路28核心，合计有56个核心。
同样4组，每一个组45bands，每一个band需要14核心，会需要3趟14核心，最后一趟3核心，空闲11核心。
如果分8组，每一个band需要7核心，4趟7核心，最后一趟2核心，空闲5核心。

看到没有，28核心中，会有更多的核心不干活。

那么回头来卡看干活的核心中，
14核心，会比12核心快很多吗？ 不一定过，CPU密集型的计算，和主频高低有很大关系。
一般而言，核心越多的处理器，主频可能稍微低一些。

可以推测，中等尺度，比如180bands这个例子，24核心处理器会比较快。
其他情形可以自己推理哦。

那么56核心平台上，可以采用其他分组吗？
分5， 6组，核心数不能整除，然后，程序会立即报错哦。  
分2组，可能比较慢哦。

一般而言，对于核心数做分解，如果因子存在类似7这样的(只能被自身和1整除，鄙人才疏学浅，搞不清楚是素数还是质数)，
在规划高效率并行计算的时候，就比较麻烦。

当然，如果你对于高效率计算，没有兴趣，
只要能算就行，那就请忽略如上信息。

特别留意，以上言论来自于我个人的有限的测试结果，不代表适用于其他情形。

另，适当设置分组数目，并行核心数目，可以十分明显提升VASP效率。
这种提升会打破传统的认识。
传统认识是，8个核心，需要10小时；16核心，最快需要5小时。
VASP中合理设定，可以实现，24核心，需要8小时；48核心，可能需要3小时不到。

以下视频中，提到一个案例。
视频链接：https://www.bilibili.com/video/BV1DK411J7tN
在双路24核心处理器，合计48CPU核心机器上，
采用默认输入文件，24核心，耗时1万多秒；
根据硬件，做合理调整后，48核心，耗时310秒。
加速效果如何，你细品。

特别留意，以上加速效果，未必对所有案例都适用。
我自己不会用VASP，只会把别人给我的输入文件，放进去运行。


特别留意，
这里提到的针对硬件的并行优化方案，
仅仅适用于VASP纯MPI版本，以及VASP MPI+OpenMP混合并行版本。
其他程序是否适用，未知。

目测对高斯必定不适用。

目测，对于高斯，
G09使用12～16核心，效率最佳，注意，不是所有核心哦；
G16，使用所有核心，效率最佳。
对于以适用G16的场景，核心越多越好了。


作者
Author: damao4361556    时间: 2020-8-1 00:50
abin 发表于 2020-7-27 22:05
三硬盘方案，是鄙人推荐的。

另，全程CPU密集型计算，还能指望全核心睿频？

个人已亲测，合适地调节NCORE NPAR 可显著提高计算速度。
作者
Author: 风飞    时间: 2020-8-1 02:35
本帖最后由 风飞 于 2020-8-1 10:38 编辑
abin 发表于 2020-7-30 21:37
一个组装服务器的商家，能对于VASP并行，用24核心和28核心处理器，
讲出来6的倍数之类的话，应该是看过关 ...

请问8171m呢？8171m应该比8175m 和8173m都好吧,   咋感觉很少人用8171m
作者
Author: sobereva    时间: 2020-8-1 04:28
风飞 发表于 2020-8-1 02:35
请问8171m呢？8171m应该比8175m 和8173m都好吧咋感觉很少人用8171m

性能是如此。
但需要华擎板子
作者
Author: sobereva    时间: 2020-8-1 04:36
提醒一下看回帖者，勿把跑VASP的情况当做普遍情况。
量化类程序、MD类程序都绝对没有核数必须是6的倍数最优的情况。例如并行核数对Gaussian不同类型任务速度的影响测试见http://bbs.keinsci.com/thread-4841-1-1.html
基于平面波的第一性原理类程序，并行涉及到k点分配、band分配、平面波分配、FFT格点的分配等，故而并行方式的控制对性能影响可调余地大，尤其是核很多的情况、跨节点的情况（例如对于QE看User's Guide for Quantum ESPRESSO和Notes on parallel computing的ppt）。对于不同情况怎么设置性能最优，和买服务器的时候买多少核的机子合适不能混为一谈。
作者
Author: abin    时间: 2020-8-1 08:43
风飞 发表于 2020-8-1 02:35
请问8171m呢？8171m应该比8175m 和8173m都好吧咋感觉很少人用8171m

不了解，不清楚。
也许正如卢大侠提到，需要特殊的主板适配。

就我个人而言，
我一般指定超微主板，因为有IPMI or BMC管理。
一两台机器，而且是放在脚边用的场景，就无所谓了。

如果是好几台，还放在机房，机房又不能随便出入，
那么有IPMI/MBC接口，就很好用了。

对了，戴尔的貌似叫做iDrac，需要额外付费的。
作者
Author: 风飞    时间: 2020-8-1 10:39
abin 发表于 2020-8-1 08:43
不了解，不清楚。
也许正如卢大侠提到，需要特殊的主板适配。

请问使用华擎主板会降低其性能吗？
作者
Author: abin    时间: 2020-8-2 00:20
风飞 发表于 2020-8-1 10:39
请问使用华擎主板会降低其性能吗？

不清楚 不了解。
问懂行的人吧。
作者
Author: sobereva    时间: 2020-8-9 05:25
风飞 发表于 2020-8-1 10:39
请问使用华擎主板会降低其性能吗？

不会
服务器主板是永擎，是以前从华擎分出去的。华擎目前做的是消费级产品。
作者
Author: wuzhiyi    时间: 2020-8-22 04:40
sobereva 发表于 2020-7-28 06:34
“并行计算要求CPU是6的倍数”根本没这回事，完全是奇谈怪论，除非特殊应用场合。居然卖服务器的人能说出这 ...

我觉得6的倍数这应该是因为7是一个素数不利于openMP层面的并行计算，于是取6，传到后面就变成是6的倍数了
作者
Author: abin    时间: 2020-8-22 21:43
上船需谨慎啊。
8175M是很不错。目前看来需要借助华擎主板。
不过貌似该主板有bug，可能会翻船哦。

前几天用一周时间，解决了一台华擎+8175M的机器，
处理后，满负荷24小时，放置48小时，故障未再现，
暂时认为Bug解决掉。
如再次出现故障，我会及时更新在这里。

Bug主要体现在，机器空闲的时候，或死机，或网卡丢失而后无法再次正常启动。

追求高性价比，要当心翻船哦。

听闻，用技嘉的某一个主板可以，不过成本略高。  <---- 这句是朋友讲的，具体不清楚，不评价。
作者
Author: CrysLantZ    时间: 2020-8-27 12:33
abin 发表于 2020-8-22 21:43
上船需谨慎啊。
8175M是很不错。目前看来需要借助华擎主板。
不过貌似该主板有bug，可能会翻船哦。

你好，我用的2696 v3 + X10DRL-I，即使重装系统，也有类似现象。
不知道您是怎么解决的？恳请指教，谢谢。

机器连接的智能插座显示，空闲时约100W功率；隔一定时间，功率变成170W或340W左右，搞不清楚什么程序在运转，这时网卡掉线且机器无法正常使用（路由器里看不到该机器）。
强制重启就好了
电脑水平有限，不知道哪里出问题了
作者
Author: sobereva    时间: 2020-8-28 03:59
wuzhiyi 发表于 2020-8-22 04:40
我觉得6的倍数这应该是因为7是一个素数不利于openMP层面的并行计算，于是取6，传到后面就变成是6的倍数了

从原理上看，我认为不是OpenMP层面的事，只是特定程序算法在并行化层面的事
作者
Author: abin    时间: 2020-8-28 10:35
CrysLantZ 发表于 2020-8-27 12:33
你好，我用的2696 v3 + X10DRL-I，即使重装系统，也有类似现象。
不知道您是怎么解决的？恳请指教，谢谢 ...

谁买给你的机器，找谁啊。

你的机器不会是静电问题吧？
接个地线试试。
作者
Author: CrysLantZ    时间: 2020-8-28 19:25
abin 发表于 2020-8-28 10:35
谁买给你的机器，找谁啊。

你的机器不会是静电问题吧？

我一直以为是系统问题，
我试试，谢谢
作者
Author: wyf4725801    时间: 2020-11-4 16:45
abin 发表于 2020-8-22 21:43
上船需谨慎啊。
8175M是很不错。目前看来需要借助华擎主板。
不过貌似该主板有bug，可能会翻船哦。

EP2C621D12 WS这个板子，我卖了1000多片，没听闻个人客户或者次级代理反映过此问题，你可以详细描述问题，然后你的简单处理方法，发我邮箱yuanfang@iway-tech.com
作者
Author: abin    时间: 2020-11-4 18:57
wyf4725801 发表于 2020-11-4 16:45
EP2C621D12 WS这个板子，我卖了1000多片，没听闻个人客户或者次级代理反映过此问题，你可以详细描述问题 ...

故障和解决方案，
找他们问去，
KF上海景丰。

我协助别人先后调试过七台，
两台出现轻微故障，散热正常，低于80度，
一台严重故障，但是散热正常。
还有一台，也是严重故障，不过散热不好，
温度能攀升到96度。

货不是我拿的，我仅仅是调试软件还有系统。

我没功夫做具体描述，
等遇到故障的时候，你就晓得了。

作者
Author: OIrH    时间: 2021-9-28 23:21
请问8173m和8175m在其它配置相同的条件下，运行相同的任务，实际功耗会差很多吗？
作者
Author: ghost    时间: 2021-9-30 08:18
8175m的性价比并不高，而且还挑主板，还不如8163，3w以内的价格是稳的



欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3