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标题: 求助两个top文件如何处理后在GROMACS进行模拟 [打印本页]

作者
Author: mhq 时间: 2020-7-28 13:45
标题: 求助两个top文件如何处理后在GROMACS进行模拟
使用VMD生成一个蛋白质的top文件和一个水+大分子的top文件后，使用GROMACS进行模拟。请问如何将这两个拓扑文件合并处理成可进行最小化的top文件。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-28 22:12
VMD没法生成top文件。writegmxtop只能生成一个壳。蛋白质的拓扑信息没理由不用pdb2gmx生成

按照手册里对top文件规则的说明自己编辑就完了

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