计算化学公社

标题: 求助：有没有好的总结cluster模型的数据库？ [打印本页]

作者
Author: successjiang 时间: 2020-7-29 09:54
标题: 求助：有没有好的总结cluster模型的数据库？
我知道Material Project是一个第一性原理中非常不错的晶体计算数据库，这个数据库中可不可以提取合适的cluster模型用于量化计算呢？如果没有，请问有其他数据库可以做到这一点么？谢谢大家。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-30 00:29
自行导出cif文件，弄成超胞，用VMD之类程序一切割就出来了
没有哪个数据库直接给你现成的簇结构（除非本来就是团簇数据库）

作者
Author: successjiang 时间: 2020-7-30 09:08

sobereva 发表于 2020-7-30 00:29
自行导出cif文件，弄成超胞，用VMD之类程序一切割就出来了
没有哪个数据库直接给你现成的簇结构（除非本来 ...

sob老师您好，比如金属氧化物簇结构，我们需要知道这个簇模型取多大性质基本收敛，以及边界条件如何处理，这些信息只能通过查阅已有文献的测试或者自己去测试吗？如果我想同时对比十几种3d，4d或者5d过渡金属氧化物的团簇模型，那这样一个一个翻阅文献，一个一个切是不是太费劲了呢？如果可以从一个现成的数据库中导出这样的已经测试好的团簇数据直接用会很便利吧，据您所知有这样的数据库吗？谢谢您。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-7-31 01:40

successjiang 发表于 2020-7-30 09:08
sob老师您好，比如金属氧化物簇结构，我们需要知道这个簇模型取多大性质基本收敛，以及边界条件如何处理 ...

d族金属构建团簇模型来做量化计算来近似模拟周期性体系的情况别轻易试，这类团簇电子结构很复杂，折腾半天可能也得不到有意义的结果，之前论坛里就讨论过。有这折腾功夫还不如学学QE做周期性计算

作者
Author: successjiang 时间: 2020-8-1 15:37

sobereva 发表于 2020-7-31 01:40
d族金属构建团簇模型来做量化计算来近似模拟周期性体系的情况别轻易试，这类团簇电子结构很复杂，折腾半 ...

sob老师您好，我建立cluster模型的主要目的是想用CDFT下的一些描述符来考察表面催化剂的催化活性，请问第一性原理程序也可以计算概念密度泛函（CDFT）下的很多描述符么（比如双描述符等）？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-8-2 04:05

successjiang 发表于 2020-8-1 15:37
sob老师您好，我建立cluster模型的主要目的是想用CDFT下的一些描述符来考察表面催化剂的催化活性，请问第 ...

CDFT的话不太适合用，主要是得涉及到不同带电状态，而周期性计算一般要求盒子里净电荷为0
基于前线轨道理论、静电势、ALIE的分析或许还可以

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