计算化学公社

标题: gromacs4.67运行添加离子的步骤,能在2018、2020版本上模拟吗? [打印本页]

作者
Author:
neutral888    时间: 2020-8-1 08:55
标题: gromacs4.67运行添加离子的步骤,能在2018、2020版本上模拟吗?
    各位老师,请问在gromacs4.67版本运行添加离子前的步骤,能在高版本2018.2020上运行能量最小化,平衡和MD模拟吗?这样做有什么影响?
    {使用旧版本的原因是因为,发现高版本在pdb2gmx一直提示拓扑角度部分出错,已求教多次无果,而低版本不出错}。

    感谢老师回答。



作者
Author:
bobosiji    时间: 2020-8-1 09:04
应该可以。没有影响
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-8-1 09:16
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,避免有歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“gromacs4.67版本与2018.2020版本”改了,以后务必注意

2018、2020都提示有问题,8成是你的用法明显有问题。

作者
Author:
neutral888    时间: 2020-8-1 09:48
sobereva 发表于 2020-8-1 09:16
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反 ...

好的,老师,谢谢您。下次注意
作者
Author:
wgg1181543722    时间: 2020-8-4 17:35
高版本的可以用低版本的文件,低版本的没法用高的  好像




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3