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标题: xtb和molclus联用搜索柔性分子构象问题求助 [打印本页]

作者
Author: deltazheng 时间: 2020-8-1 16:28
标题: xtb和molclus联用搜索柔性分子构象问题求助
卢老师您好，我最近仿照 http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html 中介绍的方法，使用xtb和molclus做MD来搜索比较复杂的柔性分子的构象，效果非常好。我现在希望在MD产生初始结构的过程中使某些键的键长固定。我看到xtb的控制文件中可以用$fix字段使原子冻结，请问这个设置是否可以用于MD任务？或者有什么方法可以在xtb做MD任务时固定某些键的键长？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-8-2 03:44
目前的xtb的MD任务没法做冻结。希望以后能予以改进
如果用ASE调用xtb跑MD或许可以设置，但性能可能会大打折扣

作者
Author: tjuptz 时间: 2020-8-3 16:30
你可以用$constrain 力常数设大一些试试

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