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标题: 求助困扰一周的问题,vasp运行报错(求帮助) [打印本页]

作者
Author:
雁笑云散    时间: 2020-8-10 12:40
标题: 求助困扰一周的问题,vasp运行报错(求帮助)
我按照sobe大神的教程在VMware下安装了vasp,进行了编译,然后按照给的Hg的例子运行也没有问题。但是当我用vasp计算自己的东西的时候,出现了以下提示。以下是运行完整的命令,哪位帮忙看下是我软件安装出了问题,还是我vasp输入文件的问题。
bash-4.2# mpirun vasp -np 1
running on    1 total cores
distrk:  each k-point on    1 cores,    1 groups
distr:  one band on    1 cores,    1 groups
using from now: INCAR     
vasp.5.4.4.18Apr17-6-g9f103f2a35 (build Aug 10 2020 11:40:49) complex         

POSCAR found type information on POSCAR  C  N  Co
POSCAR found :  3 types and      31 ions
scaLAPACK will be used

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|  ADVICE TO THIS USER RUNNING 'VASP/VAMP'   (HEAR YOUR MASTER'S VOICE ...):  |
|                                                                             |
|      You have a (more or less) 'large supercell' and for larger cells       |
|      it might be more efficient to use real space projection opertators     |
|      So try LREAL= Auto  in the INCAR   file.                               |
|      Mind:          For very  accurate calculation you might also keep the  |
|      reciprocal projection scheme          (i.e. LREAL=.FALSE.)             |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...
WAVECAR not read
WARNING: random wavefunctions but no delay for mixing, default for NELMDL
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
[guoxp:78367:0:78367] Caught signal 11 (Segmentation fault: address not mapped to object at address 0x7ffc182680c0)
==== backtrace ====
    0  /usr/lib64/libucs.so.0(+0x17970) [0x7f60c29d3970]
    1  /usr/lib64/libucs.so.0(+0x17b22) [0x7f60c29d3b22]
    2  vasp() [0x65d560]
    3  vasp() [0xdcdf83]
    4  vasp() [0xe39e48]
    5  vasp() [0x14be9df]
    6  vasp() [0x149b296]
    7  vasp() [0x40e7e2]
    8  /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x7f60c4703555]
    9  vasp() [0x40e6e9]
===================

===================================================================================
=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
=   RANK 0 PID 78367 RUNNING AT guoxp
=   KILLED BY SIGNAL: 11 (Segmentation fault)

然后就停了
希望来一位大神帮忙解决下,小弟愿意有偿求助,真心地。
作者
Author:
雁笑云散    时间: 2020-8-10 12:49
这句提示[guoxp:78367:0:78367] Caught signal 11 (Segmentation fault: address not mapped to object at address 0x7ffc182680c0)
是mpi的问题吗,我运行Hg的例子可以运行。
作者
Author:
zboan    时间: 2020-8-10 15:57
你在运行vasp之前,先试试 ulimit -s unlimited
作者
Author:
zboan    时间: 2020-8-10 15:58
zboan 发表于 2020-8-10 15:57
你在运行vasp之前,先试试 ulimit -s unlimited

我也是小白,不知道有没有用

作者
Author:
雁笑云散    时间: 2020-8-11 09:48
zboan 发表于 2020-8-10 15:58
我也是小白,不知道有没有用

谢谢啊,这个指令是获取什么权限吗
作者
Author:
zboan    时间: 2020-8-11 11:03
雁笑云散 发表于 2020-8-11 09:48
谢谢啊,这个指令是获取什么权限吗

内存限制问题,我之前也遇到和你很像的错误,就解决了
作者
Author:
zboan    时间: 2020-8-11 11:03
雁笑云散 发表于 2020-8-11 09:48
谢谢啊,这个指令是获取什么权限吗

不知道你这个问题解决了没有

作者
Author:
雁笑云散    时间: 2020-8-11 21:48
zboan 发表于 2020-8-11 11:03
不知道你这个问题解决了没有

没有,我觉得可能是我的INCAR的问题,但是不知道问题出在哪里,我是看着刘老师的视频操作例题的,您也可以看下,我估计是INCAR的问题。
谢谢你啊!
作者
Author:
ZYZhang827    时间: 2021-12-23 22:17
请问您的问题是怎么解决的呢?
作者
Author:
yydy    时间: 2022-3-22 20:52
雁笑云散 发表于 2020-8-11 21:48
没有,我觉得可能是我的INCAR的问题,但是不知道问题出在哪里,我是看着刘老师的视频操作例题的,您也可 ...

请问你解决了吗?是INCAR的问题还是openmpi的问题,我用不同的体系相同的INCAR有的会报错,有的不会
作者
Author:
Lilunjisuan    时间: 2023-4-18 11:41
yydy 发表于 2022-3-22 20:52
请问你解决了吗?是INCAR的问题还是openmpi的问题,我用不同的体系相同的INCAR有的会报错,有的不会

今天VASP跑几步就自动停了,出现这个问题,应该如何解决呢?




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