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标题: 想确定算 SCF 座标是否一样 [打印本页]

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Author: ck1030132 时间: 2020-8-14 13:56
标题: 想确定算 SCF 座标是否一样
大家好我最近在算两个分子的cyclo addition ，所以我AB两分子放一起用HF 算一次B之后再拆成A ， B两个分子单独各算一次想请教一下要怎么确定这三种计算的座标轴是同一个? 谢谢大家

作者
Author: zjxitcc 时间: 2020-8-14 14:16
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-8-14 14:21 编辑

只有一种做法能保证一样，有三个条件：（1）从AB两分子的文件里删掉A/B，剩下的坐标拿来做计算；（2）在计算过程中不开点群对称性（即不对坐标进行旋转）；（3）只算单点，不算结构优化。

不过坐标轴是否一样，并不影响标量（如能量、偶极矩大小），但是影响向量的方向（如偶极矩朝向），因此绝大多数时候讨论这个没什么意义。即使是比较结构间的RMSD，常见程序都会先做平移和坐标旋转到最大重叠的，所以不需要讨论坐标轴问题。

作者
Author: ck1030132 时间: 2020-8-14 14:28
抱歉我没有讲清楚我是要有A 分子的fock matrix 和B 分子的fock matrix 还有AB放一起算的fock matrix
我要确定座标是因为要确保AB分子OFF-diagonal term 的atomic orbital coupling 的atomic orbital
和另外算的A 分子和B 分子的fock matrix 的atomic orbital 是一样

谢谢您的回答<( _ _)>

作者
Author: zjxitcc 时间: 2020-8-14 14:30

ck1030132 发表于 2020-8-14 14:28
抱歉我没有讲清楚我是要有A 分子的fock matrix 和B 分子的fock matrix 还有AB放一起算的fock matrix
我要 ...

那就是需满足我说的三个条件。

作者
Author: ck1030132 时间: 2020-8-16 20:47

zjxitcc 发表于 2020-8-14 14:30
那就是需满足我说的三个条件。

好的，感謝您<( _ _)>

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