计算化学公社

标题: 请问高斯软件有没有加速计算的技巧? [打印本页]

作者
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Tinker    时间: 2020-8-14 16:22
标题: 请问高斯软件有没有加速计算的技巧?
本帖最后由 Tinker 于 2020-8-14 16:28 编辑

各位老师打扰了
我最近对高斯进行了测试,使用软件gaussian 09 e.01,CPU型号Intel(R) Xeon(R) Platinum 8259L,计算体系大小63个原子,含金属,
命令为:opt(calcfc) freq m06l/def2svp geom=connectivity scf=xqc
测试情况如下,
CPU数目耗时
4/10GB
10:08:12
6/10GB
8:54:35
8/10GB
5:25:57
16/10GB
4:01:50
16/20GB
4:00:14

4核到8核加速明显,8核到16核就只快了一小时,内存大小完全没影响。
请问一下这个速度合理吗,还有没有进一步压榨机器潜力的方法,谢谢了!

作者
Author:
量化小菜鸡    时间: 2020-8-14 16:29
正常的,核数与加速不是线性的。我印象不同计算(DFT或者post-HF)有建议的核数。
作者
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thanhtam    时间: 2020-8-14 16:33
换G16,并行效率能高一点
作者
Author:
喵星大佬    时间: 2020-8-14 16:34
当然合理了。。。。你测试可以说明6核并行效率低下,大概比8核的时候每核效率低1/5
再就是看一下收敛用的圈数,如果超过64轮用了二次收敛方法的话时间长了也很正常
作者
Author:
abin    时间: 2020-8-14 16:58
本帖最后由 abin 于 2020-8-14 17:06 编辑

再说一次,
G09 建议12核心, 不要多于16核心。

不晓得哪个专家瞎指挥,让G09用户占据所有核心做计算,害人啊。

G16,可以考虑使用所有核心,至少对于56核心是成立的,能保证并行效率。

注意,以上均指,在关闭超线程之后的CPU核心数目,仅仅限于Intel处理器,使用公开发售的二进制版本的高斯软件。

作者
Author:
sobereva    时间: 2020-8-15 09:30
参考并行效率测试
http://bbs.keinsci.com/thread-4841-1-1.html
作者
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Tinker    时间: 2020-8-16 08:44
sobereva 发表于 2020-8-15 09:30
参考并行效率测试
http://bbs.keinsci.com/thread-4841-1-1.html

谢谢社长
作者
Author:
Tinker    时间: 2020-8-16 08:44
abin 发表于 2020-8-14 16:58
再说一次,
G09 建议12核心, 不要多于16核心。

好的,谢谢
作者
Author:
Tinker    时间: 2020-8-16 08:45
喵星大佬 发表于 2020-8-14 16:34
当然合理了。。。。你测试可以说明6核并行效率低下,大概比8核的时候每核效率低1/5
再就是看一下收敛用的 ...

好的,谢谢




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