计算化学公社

标题: [ORCA3.0.3]安装及使用的个人体验 [打印本页]

作者
Author: zsu007 时间: 2015-10-12 11:39
标题: [ORCA3.0.3]安装及使用的个人体验
本帖最后由 zsu007 于 2016-5-9 16:22 编辑

经过与大家的讨论和积极回复，尤其钟成老师指出的openmpi的安装问题，我在单位超算中心重新编辑安装openmpi-1.6.5，现在已经能够顺利运行orca了。太谢谢大家的热心帮助!
我的主要过程如下，希望给其他遇到与我相同的问题的人参考。
1 下载openmpi-1.6.5.tar.gz，解压tar zxvf openmpi-1.6.5.tar.gz
2 进入解压目录： cd openmpi-1.6.5
3 ./configure --prefix=/public/users/hg_chy/mpi # prefix为安装目录
4 make -j4 all # 4核平行编译
5 make install
6 测试mpirun
7 设置路径：vi .bashrc #按照自己的实际情况修改路径
export LD_LIBRARY_PATH=/public/users/hg_chy/mpi/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export PATH=/public/users/hg_chy/mpi/bin:$PATH
export ORCA=/public/users/hg_chy/orca303
export PATH=$PATH:$ORCA
8 chmod -R 777 mpi # 设置高权限有利于并行
9 chmod -R 777 orca303 # 设置高权限有利于并行
10 orca使用绝对路径来提交并行任务。
祝大家愉快使用orca，多出成果！

作者
Author: zsu007 时间: 2015-10-12 11:40
本帖最后由 zsu007 于 2015-10-17 07:19 编辑

注意： / lib的/后面带有一个空格，大家拷贝的时候把这个空格删掉才能正确使用。：-）这个小问题已经修正！

作者
Author: ORCA_in_TCC 时间: 2015-10-12 13:17
还有好像是得用gfortran编译openmpi

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-10-12 17:53
"及使用的个人体验"在那里(-_-)

作者
Author: lao7 时间: 2015-10-13 07:44
gcc和C++没有安装，而且openmpi没有配置

作者
Author: 苹果 时间: 2016-5-9 10:40
3 ./confgiure --prefix=/public/users/hg_chy/mpi # prefix为安装目录，confgiure 写错，应为configure

作者
Author: zsu007 时间: 2016-5-9 16:24

苹果发表于 2016-5-9 10:40
3 ./confgiure --prefix=/public/users/hg_chy/mpi # prefix为安装目录，confgiure 写错，应为configure

谢谢指出问题，已经修改！

作者
Author: zsu007 时间: 2016-5-9 16:27

liyuanhe211 发表于 2015-10-12 17:53
"及使用的个人体验"在那里(-_-)

稍等，忙过一段时间，整理计算结果，一定首发在计算化学论坛！

作者
Author: hugo 时间: 2016-5-31 17:48
老师，您好，请问能否给我发一个orca的并行计算的脚本，谢谢。
我的邮箱：hugo07@aliyun.com

作者
Author: plus 时间: 2016-6-5 17:09

8 chmod -R 777 mpi # 设置高权限有利于并行
9 chmod -R 777 orca303 # 设置高权限有利于并行

没必要吧，755足以

作者
Author: dy19930508 时间: 2017-3-3 17:39
您好，我的系统中同时安装intel编译器和gcc编译器，在编译openmpi时用的指令是./configure --prefix=/public/users/hg_chy/mpi，但是编译完成后测试时无法并行运行，是因为系统使用了Intel编译器编译而导致mpi无法并行运行吗？谢谢！

作者
Author: zsu007 时间: 2017-3-3 19:40

dy19930508 发表于 2017-3-3 17:39
您好，我的系统中同时安装intel编译器和gcc编译器，在编译openmpi时用的指令是./configure --prefix=/publi ...

--prefix=/public/users/hg_chy/mpi 把这个--prefix= 换成你自己的文件目录。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2017-3-3 23:00
依据个人经验，补充一点：openmpi安装可以具体指定使用哪种编译器（gcc家族还是intel家族）：
./configure --prefix=自己希望安装的目录 FC=ifort CC=icc CXX=icpc F77=ifort 或
./configure --prefix=自己希望安装的目录 FC=gfortran CC=gcc CXX=g++ F77=gfortran

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