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标题: 关于理解mmpbsa结合能的问题 [打印本页]

作者
Author: 小土豆 时间: 2020-8-17 11:23
标题: 关于理解mmpbsa结合能的问题
请问一个比较基础的问题，在用mmpbsa方法计算两个分子A和B间的结合自由能时，这个结合自由能指的是A和B结合后的体系能量，还是A的能量与B的能量差值，好晕啊

作者
Author: sobereva 时间: 2020-8-17 11:52
当然是差值G(AB)-G(A)-G(B)

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-8-17 18:11
准确地说，是A和B结合后的自由能，和单独的A的自由能与单独的B的自由能之和的差值。不是你说的A和B的差值。

作者
Author: MolAICal 时间: 2020-8-18 12:18
可以参考此贴 http://bbs.keinsci.com/thread-18890-1-1.html

以及MolAICal 手册的对mm/gbsa的计算https://molaical.github.io/

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