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标题: 求助VMD绘制静电势图，结果与预期相反 [打印本页]

作者
Author: zzzl 时间: 2020-8-18 15:19
标题: 求助VMD绘制静电势图，结果与预期相反
【波函数分析求助】求助：VMD绘制静电势图，结果与预期相反

前辈们好，我想请教一个问题。
我用VMD绘制P450酶中的Compound I 和底物分子的表面静电势，得到的结果与预期的相反，想请教一下。Compound I是氧化剂，亲电试剂，周围的分子表面静电势应该为正，为什么绘制的结果黄圈中Compound I 氧原子的部分有很强的负静电势？谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-8-18 16:11
氧带负电荷，自然那部分静电势为负

你可以通过两个分子的电负性预测反应时电子的流向

作者
Author: zzzl 时间: 2020-8-18 23:42

sobereva 发表于 2020-8-18 16:11
氧带负电荷，自然那部分静电势为负

你可以通过两个分子的电负性预测反应时电子的流向

谢谢sob老师的回复，我会按照您说的做一下平均局部离子化能分析，谢谢您

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