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标题: 求助：gromacs如何计算离子在纳米通道传输过程中离子周围配位水中的氢键数目的变化？ [打印本页]

作者
Author: 邱美佳 时间: 2020-8-19 17:47
标题: 求助：gromacs如何计算离子在纳米通道传输过程中离子周围配位水中的氢键数目的变化？
gromacs如何计算离子在纳米通道传输过程中离子周围配位水中的氢键数目的变化？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-8-19 20:18
写VMD脚本，循环每一帧，用within把例子附近特定距离的水选中，然后用measure hbond命令计算出这部分水中的氢键

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