计算化学公社
标题:
怎样计算一个有机分子中质子供体的酸性和质子受体的碱性?
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作者Author:
xiaojingling016
时间:
2020-8-20 10:42
标题:
怎样计算一个有机分子中质子供体的酸性和质子受体的碱性?
现在算的一个有机分子中有个质子供体羟基和质子受体N原子,想计算质子供体的酸性和质子受体的碱性,不知道怎样计算。
作者Author:
wzkchem5
时间:
2020-8-20 16:07
比如假设你要算一个分子AH的酸性,那么可以算反应AH + B -> [A]- + [BH]+的Gibbs自由能,其中B是你的溶剂,然后按deltaG=-RTlnK就得到pKa了。注意选择准确的溶剂模型,另外各个分子附近需要加足够多的溶剂分子进行显式溶剂化。
碱性同理
作者Author:
xiaojingling016
时间:
2020-8-20 20:46
谢谢您的回答,常看到文献中说:在光激发后,分子体系的电子重新分配使得质子供体酸性和质子受体碱性都变强。酸性/碱性的增强为分子体系内发生ESIPT过程提供了更强的驱动力。出于好奇,就想算算是不是质子供体酸性和质子受体碱性都变强了。
作者Author:
sobereva
时间:
2020-8-20 22:46
如果质子在溶剂B中的溶解自由能是已知的,就没必要在计算方程中纳入B和BH+
对于同一个分子在不同情况下对比,通过与pKa有关的量就能讨论,比如可以用Multiwfn计算体系在H原子核位置的静电势(扣除这个氢的自身原子核的贡献),数值越负说明对H+结合越牢,pKa越大
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对于pKb更简单了,直接用Multiwfn做个分子表面静电势分析就完了,仔细看
使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用
http://sobereva.com/159
文献中的应用实例
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作者Author:
xiaojingling016
时间:
2020-8-21 08:17
感谢sobereva老师,您的回答对我这个问题太有用了。
作者Author:
wzkchem5
时间:
2020-8-21 20:42
xiaojingling016 发表于 2020-8-21 08:17
感谢sobereva老师,您的回答对我这个问题太有用了。
注意如果同一篇文章既需要算pKa也需要算pKb,尤其是需要相互比较的话,那么要么都按sob老师说的第一种方法算,要么都按第二种方法算,这样误差容易抵消
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