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标题: 在MD模拟结束后,如何分析盐桥的变化以及金属的配位键的变化 [打印本页]

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caroline    时间: 2020-8-21 16:29
标题: 在MD模拟结束后,如何分析盐桥的变化以及金属的配位键的变化
请问各位老师:我昨晚MD模拟后,需要对其进行盐桥的分析和金属的配位键的变化,并作出下图,我该如何进行操作呢?谢谢!


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sobereva    时间: 2020-8-21 18:42
VMD的Extensions - Analysis - Salt Bridges工具直接就能给你找出来盐桥,并且将距离随时间的变化输出出来
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caroline    时间: 2020-8-21 20:07
sobereva 发表于 2020-8-21 18:42
VMD的Extensions - Analysis - Salt Bridges工具直接就能给你找出来盐桥,并且将距离随时间的变化输出出来

请问老师,那netcdf文件在windows版本的VMD里该怎么打开呢?




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