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标题: 水-单层油-真空体系该如何构建？ [打印本页]

作者
Author: Barry624 时间: 2020-8-22 18:47
标题: 水-单层油-真空体系该如何构建？
想实现水-单层油-真空体系
1.尝试构建了8*8*8的盒子，填充了一半体积的水，并放上了64个三油酸甘油酯分子，初始结构如图一

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2.经过能量最小化和nvt，在300K下进行了10ns的md，得到的结果如图二和图三

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我的问题是：

1.这样的操作步骤是否合理？
2.为什么模拟结果中油分子没有像图四一样，头朝水，尾朝真空，铺成一层，而是混乱排列，每个油分子的三条支链的构象不规则？

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希望各位不吝赐教

作者
Author: sobereva 时间: 2020-8-23 21:17
侧向不用控压哪行

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