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标题: 求助gromacs能量最小化中间有几步出错，后来又正常了，模型可以用吗 [打印本页]

作者
Author: baima 时间: 2020-8-31 14:52
标题: 求助gromacs能量最小化中间有几步出错，后来又正常了，模型可以用吗
能量最小化的时候，没采用柔性水时，中间有几步出错，后来又正常了，过程如图，这样的模型可以用吗。采用柔性水的话，无法收敛
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作者
Author: sobereva 时间: 2020-8-31 17:43
对于动力学模拟目的，本来能量极小化过程就不需要收敛得多充分
别管em过程提示什么，只要之后MD能正常跑起来就行

作者
Author: baima 时间: 2020-9-1 14:55
本帖最后由 baima 于 2020-9-1 15:17 编辑

sobereva 发表于 2020-8-31 17:43
对于动力学模拟目的，本来能量极小化过程就不需要收敛得多充分
别管em过程提示什么，只要之后MD能正常跑起 ...

谢谢sob老师回复！

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