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标题: 求助 请问gromacs支持compass力场么 [打印本页]

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lqhenwunai    时间: 2020-9-1 10:08
标题: 求助 请问gromacs支持compass力场么
请问一下,gromacs支持compass力场么?从函数形式上看不支持。

如果我想修改gromacs函数形式,是不是只需要在相应cpp文件里添加函数,然后在top里声明func.type 就可以了?(感觉源码里函数调用关系挺复杂的)



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ABetaCarw    时间: 2020-9-1 10:53
MS独占 加密的
作者
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naoki    时间: 2020-9-1 14:24
除了MS,还有lammps支持参数不全的COMPASS力场。gromacs除了势函数不支持,主要还是COMPASS的参数搞不到
作者
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lqhenwunai    时间: 2020-9-2 09:24
ABetaCarw 发表于 2020-9-1 10:53
MS独占 加密的

谢谢。
作者
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lqhenwunai    时间: 2020-9-2 09:24
naoki 发表于 2020-9-1 14:24
除了MS,还有lammps支持参数不全的COMPASS力场。gromacs除了势函数不支持,主要还是COMPASS的参数搞不到

谢谢。
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bobosiji    时间: 2020-9-2 15:22
naoki 发表于 2020-9-1 14:24
除了MS,还有lammps支持参数不全的COMPASS力场。gromacs除了势函数不支持,主要还是COMPASS的参数搞不到

COMPASS参数只能模拟有机物么?比模拟有机物的主流免费力场opls,amber,charmm如何?能否一战?
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naoki    时间: 2020-9-2 16:12
bobosiji 发表于 2020-9-2 15:22
COMPASS参数只能模拟有机物么?比模拟有机物的主流免费力场opls,amber,charmm如何?能否一战?

COMPASS能模拟有机无机分子以及聚合物和一些固体材料,普适性很强。其他几个力场的适用范围和COMPASS比还是略窄。因为只能在MS里用,实际使用中和其他力场的比较我也不知道,但你可以看看COMPASS的两篇原文。
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bobosiji    时间: 2020-9-2 20:10
naoki 发表于 2020-9-2 16:12
COMPASS能模拟有机无机分子以及聚合物和一些固体材料,普适性很强。其他几个力场的适用范围和COMPASS比还 ...

若真有人比较compass与其他力场,而且发文章;会被MS公司禁止使用MS不?




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