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标题: 求助,有关激发态反应机理计算的问题 [打印本页]

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dumsky2019928    时间: 2020-9-4 17:49
标题: 求助,有关激发态反应机理计算的问题
本帖最后由 dumsky2019928 于 2020-9-4 22:32 编辑

预测的反应机理如下:如图1,在光照(激发态)下,C21和C22为自由基的二氢蒽醌与一氧化二氮形成桥环化合物。如图2,在光照(激发态)下,环己烷自由基中的C34将“蒽醌”中的O23H25羟基夺取下来,即形成C34O23键,断裂C22O23键
我的目的是验证在光照(激发态)下,环己烷自由基中的C34将“蒽醌”中的O23H25羟基夺取下来,即形成C34O23键,断裂C22O23键;以及,若该过程可以发生,则想要获取“夺取羟基”后,体系的结构。
我的问题是:
1.图1中的结构是在0 3,UDFT下优化而来,级别为b3lyp/def2sv,请问这一结果是否为该桥环化合物T1的结构?
2.无法确认图2中体系基态的自旋多重度是2还是4,应该如何验证?
3.图2中“C34将蒽醌中的O23H25羟基夺取下来”这一步骤是否可以通过柔性扫描验证?若可以,假设激发态体系为四重态,应在0 4以及UDFT下计算(想节省时间),还是写成0 1结合TD(tetra)来计算?
提前感谢老师与同学的指点!

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wzkchem5    时间: 2020-9-4 20:17
1. 对,不过为什么要用def2SV?应该加极化函数,def2SVP或def2SVPP
2. 分别算两个自旋多重度下的能量,取能量较低的那个
3. 验证指的是验证是否能成键吗?验证能成键,只需要做结构优化,能优化到成键的结构就行了,验证不能成键需要做柔性扫描。至于用UDFT还是UTDDFT,取决于你的体系的二重态和四重态哪个的多参考态性质更多,如果后者更多就用UTDDFT,如果前者更多或者两者差不多多就用UDFT
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dumsky2019928    时间: 2020-9-4 21:28
本帖最后由 dumsky2019928 于 2020-9-4 22:32 编辑
wzkchem5 发表于 2020-9-4 20:17
1. 对,不过为什么要用def2SV?应该加极化函数,def2SVP或def2SVPP
2. 分别算两个自旋多重度下的能量,取 ...

谢谢老师!
不加极化函数是因为我没有理解sv(p)的含义,又想节省时间,之后都会加上极化函数。
第三个问题是为了验证环己烷自由基中的C34能否将“蒽醌”中的O23H25羟基夺取下来,即形成C34O23键,断裂C22O23键能,很抱歉我的描述有些含糊
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sobereva    时间: 2020-9-5 02:42
本身不存在叫做def2-sv的基组,def2sv是Gaussian里特有的写法,等于def2-SV(P),对重原子已经加了极化函数了
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wzkchem5    时间: 2020-9-5 09:50
sobereva 发表于 2020-9-5 02:42
本身不存在叫做def2-sv的基组,def2sv是Gaussian里特有的写法,等于def2-SV(P),对重原子已经加了极化函数 ...

我的锅我的锅,刚才验证了一下,def2sv和def2svpp等价,都是def2-SV(P)。
但是有意思的是def2tzv却真的是def2-TZV,不带极化函数,我怀疑是不是高斯把def2sv实现错了,本来想实现不带任何极化函数的版本。
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biogon    时间: 2020-9-5 15:46
wzkchem5 发表于 2020-9-5 09:50
我的锅我的锅,刚才验证了一下,def2sv和def2svpp等价,都是def2-SV(P)。
但是有意思的是def2tzv却真的 ...

def2svp似乎是没有完全不含极化的版本的
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喵星大佬    时间: 2020-9-5 15:47
biogon 发表于 2020-9-5 15:46
def2svp似乎是没有完全不含极化的版本的

自定义把极化砍了就行,但这样就变成了6-31G这种没法用的玩意了
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biogon    时间: 2020-9-5 15:49
喵星大佬 发表于 2020-9-5 15:47
自定义把极化砍了就行,但这样就变成了6-31G这种没法用的玩意了

这种基组估计也就拿来测试有用了
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wzkchem5    时间: 2020-9-5 18:46
biogon 发表于 2020-9-5 15:46
def2svp似乎是没有完全不含极化的版本的

嗯我刚看了一下,确实没有,但不带def2前缀的SV是有的
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biogon    时间: 2020-9-5 19:08
wzkchem5 发表于 2020-9-5 18:46
嗯我刚看了一下,确实没有,但不带def2前缀的SV是有的

估计是没法用的东西




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