计算化学公社

标题: 拉曼光谱加弥散时,怎么计算极化率导数 [打印本页]

作者
Author:
wangchunchun    时间: 2020-9-7 12:17
标题: 拉曼光谱加弥散时,怎么计算极化率导数
在老师量子化学中关于基组的选择方法这篇文章中,我看到了关于拉曼光谱的一段话,“J. Chem. Theory Comput., 7, 3323 (2011)提出计算Raman、ROA的两步方法,在优化和振动分析时不用弥散函数(低至6-31G*高至def-TZVP就够),但是计算极化率导数的时候再考虑弥散函数(建议>= aug-cc-pVDZ)”

其中我不是很懂怎么计算极化率导数的时候考虑弥散函数,我所做的需要计算分子的拉曼光谱
我是先进行了结构优化
#p b3lyp/6-311g** opt(gdiis,maxstep=3,notrust,recalc=5) EmpiricalDispersion=GD3BJ out=wfn
然后需要进行拉曼计算,需要加弥散函数,但是看文章说振动时方法必须和优化一致,所以拉曼也只能用b3lyp/6-311g**,即#p b3lyp/6-311g** empiricaldispersion=gd3bj freq=raman
请问老师我想在算拉曼时加弥散函数应该怎么做呢


作者
Author:
sobereva    时间: 2020-9-7 13:07
至少截止到G16 C.01为止,两步法算Raman的功能都有bug,没法直接用。但两步法算ROA的功能正常,同时也会输出Raman
(, 下载次数 Times of downloads: 39)

作者
Author:
wangchunchun    时间: 2020-9-7 19:42
谢谢老师,十分感谢sob老师,祝老师工作顺利
作者
Author:
indec    时间: 2020-9-15 01:04
sobereva 发表于 2020-9-7 13:07
至少截止到G16 C.01为止,两步法算Raman的功能都有bug,没法直接用。但两步法算ROA的功能正常,同时也会输 ...

社长,ORCA 能用类似的方法两步法算拉曼吗?最近有个体系需要算拉曼,体系偏大, 高斯要算很久很久。不知道ORCA 能否降低一些耗时。
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-9-16 09:24
indec 发表于 2020-9-15 01:04
社长,ORCA 能用类似的方法两步法算拉曼吗?最近有个体系需要算拉曼,体系偏大, 高斯要算很久很久。不知 ...

ORCA应该不行。而且ORCA的振动分析速度远不如它算能量和受力,到了算Hessian的场合,相对于Gaussian的速度优势会失去大半,甚至有时还可能更慢。另外,ORCA用DFT算Raman应该是基于有限差分算的Raman活性(我没仔细证实过),因为这涉及到三阶导数,从这点上也不如Gaussian,Gaussian可以解析地计算。
作者
Author:
wangchunchun    时间: 2020-10-20 09:16
sobereva 发表于 2020-9-7 13:07
至少截止到G16 C.01为止,两步法算Raman的功能都有bug,没法直接用。但两步法算ROA的功能正常,同时也会输 ...

老师  请问在第一步中   先优化完 然后再计算振动freq可以吗  然后再进行第二步
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-10-21 11:38
wangchunchun 发表于 2020-10-20 09:16
老师  请问在第一步中   先优化完 然后再计算振动freq可以吗  然后再进行第二步


作者
Author:
wangchunchun    时间: 2020-11-2 11:05
sobereva 发表于 2020-9-7 13:07
至少截止到G16 C.01为止,两步法算Raman的功能都有bug,没法直接用。但两步法算ROA的功能正常,同时也会输 ...

老师,我用您的ROA例子试着算了一下,加了色散和溶剂,但是在加溶剂的情况下就算画不出拉曼的图像,请问老师这个我应该怎么解决呢
optfreq:#p B3LYP/6-31G* opt freq EmpiricalDispersion=GD3BJ scrf=(smd,solvent=n-hexane)
polar:#p B3LYP/aug-cc-pVDZ polar=ROA guess=read geom=check EmpiricalDispersion=GD3BJ scrf=(smd,solvent=n-hexane)
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-11-2 13:19
wangchunchun 发表于 2020-11-2 11:05
老师,我用您的ROA例子试着算了一下,加了色散和溶剂,但是在加溶剂的情况下就算画不出拉曼的图像,请问 ...

这和色散校正没关系。
看看输出文件中拉曼活性有没有输出
作者
Author:
wangchunchun    时间: 2020-11-2 20:48
sobereva 发表于 2020-11-2 13:19
这和色散校正没关系。
看看输出文件中拉曼活性有没有输出

老师    我用gview打开out文件  是有拉曼活性的   raman activity  ,但是用Multiwfn画图画不出来,不加溶剂计算的结果就能画出来
作者
Author:
sobereva    时间: 2020-11-4 14:13
wangchunchun 发表于 2020-11-2 20:48
老师    我用gview打开out文件  是有拉曼活性的   raman activity  ,但是用Multiwfn画图画不出来,不加 ...

仔细看到底运行正常结束了没有。
说不清楚就把输出文件压缩后上传,我看看
作者
Author:
大头攒毛    时间: 2023-9-8 16:34
请教一下,拉曼活性和极化率以及极化率导数之间有什么关系吗?有没有一组公式可以说明?谢谢
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-9-8 22:16
大头攒毛 发表于 2023-9-8 16:34
请教一下,拉曼活性和极化率以及极化率导数之间有什么关系吗?有没有一组公式可以说明?谢谢


参考北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html)ppt

(, 下载次数 Times of downloads: 22)





欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3