计算化学公社

标题: 求助 关于调用LigParGen 生成的itp文件 [打印本页]

作者
Author:
lqhenwunai    时间: 2020-9-10 09:54
标题: 求助 关于调用LigParGen 生成的itp文件
大家好,请问一下,我用LigParGen生成分子.itp文件, topol.itp。然后我在我的.top文件里这样调用:

#include "topol.itp"

[ system ]
PC

[ molecules ]
LIG   178


结果显示:

Fatal error:
Syntax error - File topol.itp, line 6
Last line read:
'[ atomtypes ]'
Invalid order for directive atomtypes

请问这是怎么回事呢?



作者
Author:
sobereva    时间: 2020-9-11 08:14
该有的字段必须都得有,而且顺序必须满足要求

(, 下载次数 Times of downloads: 28)

作者
Author:
zhaoxy008    时间: 2021-8-21 21:56
ATB网站上分子的itp里就没有  [ atomtypes ] 这一项,这该怎么办呢?
作者
Author:
sobereva    时间: 2021-9-8 06:25
zhaoxy008 发表于 2021-8-21 21:56
ATB网站上分子的itp里就没有  [ atomtypes ] 这一项,这该怎么办呢?

在ATB网站提供的修改版GROMOS力场包里




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3