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标题: 求助：磺酸基催化水解的过渡态搜索问题 [打印本页]

作者
Author: EdwardLimit 时间: 2020-9-11 10:46
标题: 求助：磺酸基催化水解的过渡态搜索问题
各位老师好，小弟最近在uio-66上接枝磺酸基来研究磺酸基对纤维二糖的水解机理. 采用MS建模后带入vasp进行结构优化，如下图所示，发现系统中所有原子除了磺酸基上氢原子都达到了力的收敛标准。我们想问下，当采用CINEB研究磺酸基对纤维二糖的水解过渡态时，能不能将磺酸基上的氢去掉，在初始结构中加几个水分子来构建溶液环境。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-9-11 11:50
可以（而且必须）加水分子。既然是水解，我猜你的溶剂是水，那么磺酸基必然会和好几个水形成强氢键，甚至直接把质子电离给水。如果不加水，相当于本来一个稀硫酸催化的反应变成了用浓硫酸催化，完全不是一码事了。

作者
Author: EdwardLimit 时间: 2020-9-12 23:43

wzkchem5 发表于 2020-9-11 11:50
可以（而且必须）加水分子。既然是水解，我猜你的溶剂是水，那么磺酸基必然会和好几个水形成强氢键，甚至直 ...

谢谢您。

作者
Author: 胡其林123 时间: 2020-11-28 17:22
您好师兄，您也在做水解吗？能给师弟一个联系方式吗，最近也在做这个想请教下师兄

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