计算化学公社

标题: gmx genion添加离子的问题？ [打印本页]

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2020-9-11 22:22
标题: gmx genion添加离子的问题？
gmx genion添加离子，盒子中有足够的水，添家离子的时候，添加的多的时候，显示无空间，这是为什么呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-12 04:16
加入的浓度特别高的情况genion没法弄
改用packmol之类其它方式构建

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2020-9-14 10:59

sobereva 发表于 2020-9-12 04:16
加入的浓度特别高的情况genion没法弄
改用packmol之类其它方式构建

那这种话，像氯离子，这种的pdb文件，直接用高斯画一个原子就行了？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-16 09:32

努力向上的boy 发表于 2020-9-14 10:59
那这种话，像氯离子，这种的pdb文件，直接用高斯画一个原子就行了？

对

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