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标题: 请教活性口袋有金属离子的分子对接用什么软件比较靠谱？ [打印本页]

作者
Author: azero 时间: 2020-9-13 13:34
标题: 请教活性口袋有金属离子的分子对接用什么软件比较靠谱？
有一个酶活性口袋有一个Ca 离子，用ledock对接，效果非常差，vina也不够好。请问用什么对接软件比较靠谱？

作者
Author: puzhongji 时间: 2020-9-13 17:38
（2）Comparative Assessment of 7 Docking Programs on a Non-Redundant Metalloprotein Subset of the PDBbind Refined

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-14 06:14
对于位点都已经很明确的情况，可以直接拿vina对接进去的结构跑个长时间动力学或者周期退火，帮助确定比较稳定的结合方式，这样比用对接更靠谱。

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