计算化学公社

标题: conpute_vacf命令计算速度自相关函数求助 [打印本页]

作者
Author:
txh    时间: 2020-9-14 21:00
标题: conpute_vacf命令计算速度自相关函数求助
   请问一下各位老师,我用lammps的conpute_vacf命令计算的VACF,然后根据数据作图,发现并不一样,请问一下各位我应该怎样改正,另外计算vacf的命令如下:compute VACF  all vacffix VACF all ave/time 1 12 ${ndump} c_VACF[1] c_VACF[2] c_VACF[3] c_VACF[4] file vacf.lammps




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txh    时间: 2020-9-14 21:01
compute VACF  all vacf
fix VACF all ave/time 1 12 ${ndump} c_VACF[1] c_VACF[2] c_VACF[3] c_VACF[4] file vacf.lammps
这是命令行,发现发的串行了
作者
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dummy1    时间: 2020-9-15 12:15
txh 发表于 2020-9-14 21:01
compute VACF  all vacf
fix VACF all ave/time 1 12 ${ndump} c_VACF[1] c_VACF[2] c_VACF[3] c_VACF[4]  ...

你取的时间太长了,文献2ps相关性就没有了。
在就是,你的帧数够多吗?
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txh    时间: 2020-9-15 15:28
dummy1 发表于 2020-9-15 12:15
你取的时间太长了,文献2ps相关性就没有了。
在就是,你的帧数够多吗?

好像确实不够,文献是0.005ps一步,我取得有点大了,另外是不是还要进行归一化处理?
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dummy1    时间: 2020-9-16 01:43
txh 发表于 2020-9-15 15:28
好像确实不够,文献是0.005ps一步,我取得有点大了,另外是不是还要进行归一化处理?

一般需要归一化, 但是应该不影响你的线形
作者
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txh    时间: 2020-9-16 08:40
dummy1 发表于 2020-9-16 01:43
一般需要归一化, 但是应该不影响你的线形

我按照文献,0.005 ps取了一个值,又算了一遍但是还是算不出文献那种图形,虽然体系不一样,但是我看VACF文献中都是那种形式的曲线,我这个为什么还是不对啊,还请老师解答一下。




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