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标题: 类似的分子，同样的计算方法只能使一个分子的吸收谱和实验对应的好，该如何处理 [打印本页]

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Author: 破晓时的曙光 时间: 2020-9-15 18:29
标题: 类似的分子，同样的计算方法只能使一个分子的吸收谱和实验对应的好，该如何处理
对于两个非常相似的分子，我都是用的wb97xd进行优化，然后对得到的优化好的基态分子，利用optDFTw分别对两个分子调控wb97xd泛函中的w，接着利用得到的w分别计算两种分子的吸收谱，溶剂模型为PCM，溶剂与实验一致均为甲苯，泛函和基组为wb97xd/def2SVP，计算得到的激发态和实验对比，发现只有一个分子和实验吸收谱较为接近，另一个分子差得有点多，请问这个该如何处理呢。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-9-15 19:54
两个分子的w差得多吗？

作者
Author: 破晓时的曙光 时间: 2020-9-15 21:58
差不多，两个分子调控下来的w差0.003

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-9-15 22:14

破晓时的曙光发表于 2020-9-15 21:58
差不多，两个分子调控下来的w差0.003

有一种可能是，你的分子太容易发生分子间pi-pi堆积了，实验上测得的可能是dimer的谱。
我之前遇到过计算的发射谱和实验对不上，结果发现实验的发射谱是dimer发射的情形，吸收可能也有类似现象。

作者
Author: 破晓时的曙光 时间: 2020-9-15 22:21
溶液里面也很容易发生pi-pi堆积吗

作者
Author: Trivers 时间: 2020-9-16 00:33
接着楼上那位老师的问题~这两个分子看起来都有非常刚性的共轭结构，这样的结构一般来说溶解度不是很好，所以我想请教一下，楼主如何保证在测试吸收的过程中，如何保证样品完全溶解呢？如果样品没有完全溶解，是有可能出现dimer或者多聚体的，这样的情况有可能使得实验光谱与计算不匹配。另外，楼主提供的两个实验的吸收谱范围不太一样，起峰的位置也不是很明确，个人建议把250nm-600nm的吸收都贴出来看一下，比较好分析。

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