计算化学公社

标题: 求助g_mmpbsa算PB部分的时候报错:Segmentation fault (core dumped) [打印本页]

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eagletyr    时间: 2020-9-17 14:14
标题: 求助g_mmpbsa算PB部分的时候报错:Segmentation fault (core dumped)
求助:用g_mmpbsa计算第二步的PB部分时,报错:Parsing input file pqbyBxqA.in... Segmentation fault (core dumped)。
运行官方的体系http://rashmikumari.github.io/g_ ... binding_energy.html,以及自己的体系时均报此错。
gromacs版本为:2019.5. 系统为centos 7.6。 g_mmpbsa版本为官方已编译好的(已内置APBS)。已知同样的软件版本在另一台电脑上可正常运行。多谢。
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caoyangang    时间: 2021-2-4 10:42
请问楼主,你的问题解决了吗,我遇见同样的问题,可否指教一二
作者
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eagletyr    时间: 2021-4-1 10:40
caoyangang 发表于 2021-2-4 10:42
请问楼主,你的问题解决了吗,我遇见同样的问题,可否指教一二

没解决,还是同样的问题
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monte    时间: 2021-4-22 14:11
我也是这个问题,gromacs2018.8也是这样
Parsing input file pTZdmjsA.in...
Segmentation fault (core dumped)
系统是centos7.8的
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Zhaoyang    时间: 2021-6-26 02:31
我也遇到了这样的错误,gromacs用的是最新版的,g_mmpbsa用的是预编译5.1.x的,系统是centos8,请问有解决这个问题的了吗
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sobereva    时间: 2021-6-26 03:43
Zhaoyang 发表于 2021-6-26 02:31
我也遇到了这样的错误,gromacs用的是最新版的,g_mmpbsa用的是预编译5.1.x的,系统是centos8,请问有解决 ...

索性换个工具
http://bbs.keinsci.com/thread-23634-1-1.html
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Zhaoyang    时间: 2021-6-27 03:57
sobereva 发表于 2021-6-26 03:43
索性换个工具
http://bbs.keinsci.com/thread-23634-1-1.html

感谢,我学习一下




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