计算化学公社

标题: AC建模的体积大于实际计算体积怎么处理 [打印本页]

作者
Author: 小小白 时间: 2020-9-19 11:40
标题: AC建模的体积大于实际计算体积怎么处理
请教各位前辈和老师，用AC模块建模1000个N2分子，已设密度，但所得盒子体积大于实际计算的体积，体系比较松散，nvt计算所得压强不准确，请问怎么可以在MS里调整盒子大小？或者有其他方法确定体积？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-19 12:55
跑NPT啊

作者
Author: 小小白 时间: 2020-9-19 17:23

sobereva 发表于 2020-9-19 12:55
跑NPT啊

老师，那请问跑NPT的话我的体系压强怎么设置，我的目的是计算体系的压强

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-20 07:38
如果你要计算特定盒子尺寸下的压强，NVT算出来是多少就是多少，不存在什么“盒子体积大于实际计算的体积，体系比较松散”以及结论“nvt计算所得压强不准确”

作者
Author: 小小白 时间: 2020-9-20 09:27

sobereva 发表于 2020-9-20 07:38
如果你要计算特定盒子尺寸下的压强，NVT算出来是多少就是多少，不存在什么“盒子体积大于实际计算的体积， ...

谢谢sob老师的回复。我用AC建的结构计算同等条件下的压强比实验值小了一半，但用别人例子中的结构计算却是合适的。例子中的结构和我用AC模块建的结构密度都是一样的，但是我的结构比例子结构的体积大，看着比较松散，所以想请教sob老师。应该怎么调整。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-21 13:01

小小白发表于 2020-9-20 09:27
谢谢sob老师的回复。我用AC建的结构计算同等条件下的压强比实验值小了一半，但用别人例子中的结构计算却 ...

我不用ac
packmol比ac灵活强大得多，设个盒子范围，想往里面堆多少就堆多少。盒子的尺寸和分子数都是自己直接控制的

分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473（http://bbs.keinsci.com/thread-12549-1-1.html）

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Author: 小小白 时间: 2020-9-21 15:19

sobereva 发表于 2020-9-21 13:01
我不用ac
packmol比ac灵活强大得多，设个盒子范围，想往里面堆多少就堆多少。盒子的尺寸和分子数都是自 ...

嗯嗯，谢谢sob老师，我看看packmol

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