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标题: 求助(Y2O3)2团簇结构优化方法和基组的选择 [打印本页]

作者
Author: 蒋小乐 时间: 2020-9-19 16:21
标题: 求助(Y2O3)2团簇结构优化方法和基组的选择
卢老师你好，我准备对一个金属氧化物团簇结构进行优化，现在初始结构已经搭建完成，金属氧化物为(Y2O3)2,含有4个钇原子，6个氧原子，我用的是Linux系统下的Gaussian16，40核，能接受的计算时长不做要求，请问我该选用何种方法和基组？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-20 07:39
这么小体系，直接用def2-TZVP

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-9-20 11:42
泛函可考虑B2PLYP等双杂化泛函

作者
Author: 蒋小乐 时间: 2020-9-30 17:22

sobereva 发表于 2020-9-20 07:39
这么小体系，直接用def2-TZVP

卢老师，你好，昨天我在QQ群里咨询了优化稀土氧化物团簇（5-50个原子）的问题，您提到对于几十个原子的体系用def2-TZVP耗时太高的问题，推荐我用SDD搭配6-311G*,我查了手册后，写的其中一个输入文件见附件，运行了并没有报错，您看上述所有团簇体系是否都可用这种方法和基组？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-30 19:13

蒋小乐发表于 2020-9-30 17:22
卢老师，你好，昨天我在QQ群里咨询了优化稀土氧化物团簇（5-50个原子）的问题，您提到对于几十个原子的体 ...

关键词没问题。
没必要刻意写MWB28，直接写SDD多省事，仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60

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Author: 蒋小乐 时间: 2020-9-30 19:20

sobereva 发表于 2020-9-30 19:13
关键词没问题。
没必要刻意写MWB28，直接写SDD多省事，仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝 ...

好的谢谢老师了同时祝老师中秋快乐，工作顺利，合家欢乐！

作者
Author: 蒋小乐 时间: 2020-10-11 10:08

sobereva 发表于 2020-9-30 19:13
关键词没问题。
没必要刻意写MWB28，直接写SDD多省事，仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝 ...

老师你好计算体系电子能量时，可否继续用该方法和基组，是否要选用更高级别的基组？

作者
Author: biogon 时间: 2020-10-11 10:14

蒋小乐发表于 2020-10-11 10:08
老师你好计算体系电子能量时，可否继续用该方法和基组，是否要选用更高级别的基组？

算的动的话可以考虑CCSD(T)，或者降到双杂化，基组最少也要用def2tzvp

作者
Author: 蒋小乐 时间: 2020-10-11 10:22

biogon 发表于 2020-10-11 10:14
算的动的话可以考虑CCSD(T)，或者降到双杂化，基组最少也要用def2tzvp

好的，我计算试试看

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-10-11 17:38

蒋小乐发表于 2020-10-11 10:22
好的，我计算试试看

团簇的话CCSD(T)未必靠谱，还是要看静态相关的情况

作者
Author: 蒋小乐 时间: 2020-10-12 09:53

喵星大佬发表于 2020-10-11 17:38
团簇的话CCSD(T)未必靠谱，还是要看静态相关的情况

昨天我试了CCSD(T),算不动，而且空间占用很大，请问老师对于该体系单点能的计算有没有推荐的方法和基组？

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-10-12 11:07

蒋小乐发表于 2020-10-12 09:53
昨天我试了CCSD(T),算不动，而且空间占用很大，请问老师对于该体系单点能的计算有没有推荐的方法和基组？ ...

如果高斯的话CCSD(T)当然是算不动咯，可以用ORCA的DLPNO-CCSD(T)或者双杂化，速度还可以，就是SCF相当难收敛，可能需要用VerySlowConv之类的关键词，然而即使这样也很有可能不收敛，稀土金属团簇本来就是难收敛的体系

作者
Author: zjxitcc 时间: 2020-10-12 11:10

喵星大佬发表于 2020-10-12 11:07
如果高斯的话CCSD(T)当然是算不动咯，可以用ORCA的DLPNO-CCSD(T)或者双杂化，速度还可以，就是SCF相当难 ...

他估计搞不定，DLPNO占硬盘也很严重

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-10-12 11:13

zjxitcc 发表于 2020-10-12 11:10
他估计搞不定，DLPNO占硬盘也很严重

我寻思稀土金属团簇本来就是很难搞得玩意，原理上应该用多参考但那玩意更麻烦

作者
Author: 蒋小乐 时间: 2020-10-12 22:07

sobereva 发表于 2020-9-30 19:13
关键词没问题。
没必要刻意写MWB28，直接写SDD多省事，仔细看
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝 ...

老师你好，对于上述体系OPT+freq采用B3LYP泛函，基组选用SDD搭配6-311G*;计算单点能采用双杂化泛函B2PLYP/def2tzvp，请问这样是否合理可行？

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2020-10-13 01:27

蒋小乐发表于 2020-10-12 22:07
老师你好，对于上述体系OPT+freq采用B3LYP泛函，基组选用SDD搭配6-311G*;计算单点能采用双杂化泛函B2PLYP ...

B3LYP描述这种体系可能是一坨。。。。。可以用BP86，SCAN，MN15L，TPSS之类的优化看看先

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-13 06:24

蒋小乐发表于 2020-10-12 22:07
老师你好，对于上述体系OPT+freq采用B3LYP泛函，基组选用SDD搭配6-311G*;计算单点能采用双杂化泛函B2PLYP ...

关于B3LYP优化过渡金属（稀土也算）配合物的问题，此文说了
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557（http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html）

要用双杂化就用带D3校正的。B2PLYP-D3(BJ)算能量明显强于B2PLYP

作者
Author: 蒋小乐 时间: 2020-10-14 15:40

sobereva 发表于 2020-10-13 06:24
关于B3LYP优化过渡金属（稀土也算）配合物的问题，此文说了
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化 ...

好谢谢老师！

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