标题: 求助：进行分子动力学模拟的out文件出现wrapping first mol [打印本页] 作者Author: chensy 时间: 2020-9-22 08:26 标题: 求助：进行分子动力学模拟的out文件出现wrapping first mol 请问在进行蛋白-配体的分子动力学模拟的时候，中途出现wrpping first mol，会不会对之后的运动轨迹的分析有影响？
作者Author: sobereva 时间: 2020-9-22 17:44
之后看看轨迹，如果蛋白、配体分子运动没有问题、轨迹是连续的就没事作者Author: DoubeeTwT 时间: 2020-9-24 10:48
应该是没有问题的，如果你不想要wrap,在md.in里可以把参数修改了不要做
iwrap=1, ! The coordinates written to the restart and trajectory files will be "wrapped" into a primary box.
把iwrap改成0或者删除这个参数设置