计算化学公社

标题: 烯醇互变异构过渡态的寻找 [打印本页]

作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-21 10:28
标题: 烯醇互变异构过渡态的寻找
本帖最后由 ct_2015 于 2015-10-21 10:36 编辑

RT,结构如图。本人使用ts和qst2方法寻找到了可疑过渡态,但是经过IRC计算验证连接的起始物和产物不正确,请高手帮忙解答下,跪谢!

作者
Author:
liyuanhe211    时间: 2015-10-21 13:19
把现在算出来的过渡态提供一下(-_-)
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-21 14:29
计算过渡态的输出文件,谢谢!@liyuanhe211
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-21 14:43
这是TS方法计算的结果,谢谢!@liyuanhe211
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-10-21 18:24
把TS和QST2产生的TS下做的IRC的输出文件都贴上来。
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-22 10:26
TS产生的TS做的IRC的输出文件@sobereva
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-22 10:34
不好意识,分子结构好像画错了,其杂五元环的氧原子应该是氮原子@sobereva @liyuanhe211
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-22 10:36
QST2产生的TS做的IRC的输出文件今天已不能上传了,太大了,明天再传@sobereva
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-10-22 12:57
ct_2015 发表于 2015-10-22 10:36
QST2产生的TS做的IRC的输出文件今天已不能上传了,太大了,明天再传@sobereva


传之前先压缩啊,这样别人下载快,还省论坛空间。或者传网盘也行。
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-22 14:02
sobereva 发表于 2015-10-22 12:57
传之前先压缩啊,这样别人下载快,还省论坛空间。或者传网盘也行。

对啦,没想到这个
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-22 14:08
http://pan.baidu.com/s/1eQDFHHS QST2法得TS后IRC计算后的输出文件,在网盘,麻烦Sob老师自己下载,谢谢!
@sobereva
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-10-22 17:16
我看了,很正常嘛。整个迁移是两步过程,先从C8迁移到C9,再迁移到O14。
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-22 19:45
sobereva 发表于 2015-10-22 17:16
我看了,很正常嘛。整个迁移是两步过程,先从C8迁移到C9,再迁移到O14。

那Sob老师的意思是这个异构化反应是两步反应么,中间还有个中间产物?@sobereva
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-10-22 22:14
ct_2015 发表于 2015-10-22 19:45
那Sob老师的意思是这个异构化反应是两步反应么,中间还有个中间产物?@sobereva

yes
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-10-23 09:19
sobereva 发表于 2015-10-22 22:14
yes

thank you very much!
作者
Author:
liyuanhe211    时间: 2015-10-23 10:29
sobereva 发表于 2015-10-22 17:16
我看了,很正常嘛。整个迁移是两步过程,先从C8迁移到C9,再迁移到O14。

这么说中间经历了一个单线态双自由基过程?感觉不大常见啊。
(, 下载次数 Times of downloads: 53)



作者
Author:
sobereva    时间: 2015-10-23 10:37
liyuanhe211 发表于 2015-10-23 10:29
这么说中间经历了一个单线态双自由基过程?感觉不大常见啊。

这个体系直接迁移的话距离太远,很难过去,而且从IRC上看确实是两步才实现的
作者
Author:
liyuanhe211    时间: 2015-10-23 10:44
sobereva 发表于 2015-10-23 10:37
这个体系直接迁移的话距离太远,很难过去,而且从IRC上看确实是两步才实现的

是不是像碳酸分解的过渡态一样,中间应该有什么物种(比如水,质子化的碱之类的)Relay一下氢?
作者
Author:
kevin    时间: 2015-10-24 08:58
sobereva 发表于 2015-10-22 17:16
我看了,很正常嘛。整个迁移是两步过程,先从C8迁移到C9,再迁移到O14。

sob老师,我就这个问题问您一下,他这里的互变异构反应您说有两步氢的迁移,是所有的这样的反应都是这样么?我算过类似的反应,一般都是让C8上的氢直接到O14(以他的计算为例),能垒一般都很高。
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-10-24 12:06
kevin 发表于 2015-10-24 08:58
sob老师,我就这个问题问您一下,他这里的互变异构反应您说有两步氢的迁移,是所有的这样的反应都是这样 ...

也没准儿有那样的IRC,但是可能不好找,势垒又高,不如这种两步过程容易发生。
作者
Author:
kevin    时间: 2015-10-24 16:57
liyuanhe211 发表于 2015-10-23 10:29
这么说中间经历了一个单线态双自由基过程?感觉不大常见啊。

请问你算出来这个了么 ?我也很好奇这个双自由基能不能算出来。
作者
Author:
liyuanhe211    时间: 2015-10-24 18:15
kevin 发表于 2015-10-24 16:57
请问你算出来这个了么 ?我也很好奇这个双自由基能不能算出来。

呃(-_-)我为什么要算楼主的体系
作者
Author:
kevin    时间: 2015-10-24 21:11
liyuanhe211 发表于 2015-10-24 18:15
呃(-_-)我为什么要算楼主的体系

sorry,看错了,还以为你是楼主呢。。。。抱歉抱歉
作者
Author:
SET    时间: 2015-11-4 12:12
中间应该有什么物种(比如水,质子化的碱之类的)Relay一下氢---应该是这样的
作者
Author:
planet5460    时间: 2015-11-7 20:37
本帖最后由 planet5460 于 2015-11-7 20:58 编辑

楼主可以考察下,H在C8和O14之间的振动模式,是一个四元环的结构,可能能垒要比这种在键上的H转移的能垒要低一些。我之前做过一个烯醇式结构,好像是这种情况,不过说不准,所以两种情况你都要考察,选能垒最低的路径。
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-11-21 16:17
哎呀!我不在的这段时间想不到楼上都讨论得这么激烈了哈!谢谢各位啦!
我是按Sob老师的方法分两步计算的,想按@planet5460 兄的另外一种四元环结构算下试试。

作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-11-21 16:20
kevin 发表于 2015-10-24 16:57
请问你算出来这个了么 ?我也很好奇这个双自由基能不能算出来。

可以算出来的
作者
Author:
ct_2015    时间: 2015-11-21 16:27
planet5460 发表于 2015-11-7 20:37
楼主可以考察下,H在C8和O14之间的振动模式,是一个四元环的结构,可能能垒要比这种在键上的H转移的能垒要 ...

请问这个四元环的结构怎么找,我用TS或者QST2都没有找到这种四元环结构的过渡态?




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3