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标题: 求助: 从COD晶体下载来的Fe3O4的晶体结构,为什么看原子性质的时候charge为0 [打印本页]

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ocbrother    时间: 2020-9-23 14:32
标题: 求助: 从COD晶体下载来的Fe3O4的晶体结构,为什么看原子性质的时候charge为0
从COD下载的Fe3O4的晶体结构,用MS打开后,点击每一个原子,在properties里面的charge显示都是0,照理说四氧化三铁不是应该含有三价铁、二价铁和氧离子吗?
求老师们指点迷津

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naoki    时间: 2020-9-23 14:52
这个晶体文件只包含了原子坐标和晶胞参数等信息吧, 没有电荷信息
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ocbrother    时间: 2020-9-23 16:01
naoki 发表于 2020-9-23 14:52
这个晶体文件只包含了原子坐标和晶胞参数等信息吧, 没有电荷信息

那我之后在进行分子动力学模拟的时候,要考虑晶体里面各个元素的电荷吗?
还是说我在选择力场的时候,比如compass力场,它会自动分配电荷吗?
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naoki    时间: 2020-9-23 16:09
ocbrother 发表于 2020-9-23 16:01
那我之后在进行分子动力学模拟的时候,要考虑晶体里面各个元素的电荷吗?
还是说我在选择力场的时候,比 ...

如果你打算用ms模拟的话,forcite模块里energy选项卡会让你选电荷的计算方法,可以选力场自动分配、使用当前电荷或者Qeq等算法。当然你也可以自己手动设定每个原子的电荷。
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ocbrother    时间: 2020-9-23 17:48
naoki 发表于 2020-9-23 16:09
如果你打算用ms模拟的话,forcite模块里energy选项卡会让你选电荷的计算方法,可以选力场自动分配、使用 ...

好的。谢谢你




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