计算化学公社

标题: 求助：annealing过程应该在初始温度下产生速度吗？ [打印本页]

作者
Author: muxchong 时间: 2020-9-23 22:51
标题: 求助：annealing过程应该在初始温度下产生速度吗？
各位老师好，请教两个小问题：
（1）我想要在最后一步production run时在前2 ns内将温度由50 K升至300 K,并且想用不同初始速度平行模拟多条轨迹，所以gen_vel=yes. 这时gen_temp应该是设为50 K还是300 K呢？

（2）我在NVT平衡的时候已经产生过速度，production run重新产生速度这样有影响吗？想要用不同初始速度平行模拟多条轨迹，初始速度什么时候产生最合适呢
谢谢大家

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-24 10:37
1 50
2 “影响”语义不明。显然你重新产生初速度就不可能延续之前最终的状态精确续跑。从实际来说，由于MD的混沌效应很强（见《数值误差对计算化学结果重现性的影响》http://sobereva.com/88），只要你跑了足够的时间，不同轨迹的相关性通常就已经极弱了，所以不产生初速度也可以。

作者
Author: muxchong 时间: 2020-9-24 11:04

sobereva 发表于 2020-9-24 10:37
1 50
2 “影响”语义不明。显然你重新产生初速度就不可能延续之前最终的状态精确续跑。从实际来说，由于MD ...

谢谢Sob老师的解释

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)