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标题: 求助：如何产生两个基团库任意组合形成的所有合理的化学分子 [打印本页]

作者
Author: Novice 时间: 2020-9-25 12:11
标题: 求助：如何产生两个基团库任意组合形成的所有合理的化学分子
本帖最后由 Novice 于 2020-9-25 12:47 编辑

如题，假如我有A基团库为苯、萘、蒽、吡啶、喹啉等，而B基团库为氰基、卤素、甲基、苯、萘、蒽等。我现想从A库中取一个基团，而从B库中取任意多个基团（少于等于A的取代位点个数，而且允许其中某个基团使用多次）对A中的基团进行取代，从而产生出A被B取代的所有可能分子。请问各位是否有现有的软件、方法或者代码可以做到？
PS. 我知道社长有个帖子《基于OpenBabel批量产生特定基团以任意方式接到苯上的结构的方法》http://bbs.keinsci.com/thread-10824-1-1.html，但是好像实现不了我的要求。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-9-25 15:44
通过自己写代码组合SMILES字符串是可以实现的

作者
Author: xuhj199508 时间: 2021-8-10 12:59
请问前辈，您找到现有软件或者方法实现此功能了嘛？

作者
Author: Novice 时间: 2021-8-11 18:58

xuhj199508 发表于 2021-8-10 12:59
请问前辈，您找到现有软件或者方法实现此功能了嘛？

你好，我找人帮我做的，但是具体过程我也没问，我仅知道是借助RDkit实现的

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