计算化学公社

标题: 求助电子密度差图分析团簇中的电荷转移和强弱 [打印本页]

作者
Author:
suosuosky    时间: 2020-9-29 02:55
标题: 求助电子密度差图分析团簇中的电荷转移和强弱
本帖最后由 suosuosky 于 2020-9-29 03:05 编辑

请问sob老师,在分析双体或者三体团簇的电子密度差图时,分析不同分子间作用时有些糊涂,请老师指点!谢谢老师!

1-如图1,分析Te...N 硫键:因为第一个图中Te和N上的电子密度都减少,而第二个图中Te电子密度减小,N上电子密度又增加,为什么变化会不同呢?

2-如图2和图3,H2O的dimer中,H和O之间的电子密度都减少,而四个水H2O的团簇中O上又出现电子密度增加,请问老师应该如何理解团簇分子间作用电子密度增加和降低?

3-如图4中,文件描述为:As can be seen, electron density is shifted from the metal atom of MX (M=Cu, Ag, Au; X=F, Cl, Br) toward the P/O atoms in the H3PO/PH2OH.
可是按照理解,M上有sima-hole,显示正电,按照静电作用,不应该是电子密度从P/O向M转移吗?还是我的理解有错误?电子密度差和静电作用、电负性应该是什么关系呢?有些迷糊。


4-如图5和6中,分别为FBr...NC-M 和 H3N...Br-M 卤键,其中M是相同的基团。取相同的等值面,可是为什么从图上看两种情况的电子密度差不一样呢?前者分子间有电子密度累积,后者却没有。

5-请问老师如何根据电子密度差图分析较强的分子间作用,比如磷键等,如何说明具有分子间作用有一定的共价性?


恳请sob老师给与指点,谢谢老师!





作者
Author:
sobereva    时间: 2020-9-29 14:43
1 我不知道文章怎么定义的密度差,是谁减谁,没法评论

2 要想把二聚体和四聚体对比,等值面数值、计算级别必须统一,否则不好评论。而且应注意二聚体和四聚体中单体间相对朝向也不同,视角不同也影响对比和判断。

3 光从这图上看不出来是AuF往CH2PHO转移。可以结合CDA做更进一步的分析
使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166

4 问此类问题需要注明颜色代表的含义
等值面图看到的图像和等值面数值关系极大,不能光拿一个等值面数值的情况说事。用平面填色等值线图展现得最为充分,可避免含糊性

5 一般磷键的共价性极其微弱
绘制密度差图,如果在作用区域看到电子密度轻微增加,可以从这个角度上说明有轻微的共价性。
作者
Author:
qian04551    时间: 2021-4-22 16:24
您好,方便说一下第一张图对应的哪一篇文献吗?




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3