计算化学公社

标题: Gview看HOMO和LUMO不全的问题 [打印本页]

作者
Author: sunnyyg 时间: 2015-10-24 13:21
标题: Gview看HOMO和LUMO不全的问题
本帖最后由 sunnyyg 于 2015-10-24 13:23 编辑

大家好，我将卟啉衍生物分子基态优化后，关键词：#p opt freq cam-b3lyp/genecp scrf=(iefpcm,solvent=thf) pop=(nbo,savenbo) geom=connectivity
得到chk文件，转换成fchk后，用gview查看HOMO。右键-results-surfaces and contours-new cube-new surface
结构只看到了一部分

HOMO应该分布在整体卟啉环上，可是怎么只有一部分呢？

作者
Author: 卒之爱 时间: 2015-10-24 14:26
用别的软件试试，比如Camcraft

作者
Author: sunnyyg 时间: 2015-10-24 14:59
用了multiwfn也不行

作者
Author: diaolanxinyu 时间: 2015-10-24 22:04
直接点Edit-MOs试试

作者
Author: diaolanxinyu 时间: 2015-10-24 22:13
或者尝试调节isovalue的值来显示MO,
或者把fchk文件上传，
或者只算加pop=nbo的单点能再画MO试试

作者
Author: sobereva 时间: 2015-10-25 02:17
去掉saveNBO

NBO和MO完全是两码事。默认将MO保存到chk里，你写这个说明将NBO代替MO保存到chk里。NBO是高度定域的轨道，你看到的自然只是定域在局部的轨道了，这根本不是HOMO。

附：
看NBO轨道的方法：
使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
http://sobereva.com/134

看分子轨道的方法：
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269

作者
Author: anmin0127 时间: 2015-10-26 08:59
计算是正常完成的吗？

作者
Author: sunnyyg 时间: 2015-10-26 09:09

anmin0127 发表于 2015-10-26 08:59
计算是正常完成的吗？

log文件结尾是这样的：
IT MATTERS NOT HOW DEEP YOU PLOW,
BUT HOW LONG YOU STAY IN THE FURROW.
Job cpu time: 20 days 17 hours 43 minutes 21.3 seconds.
File lengths (MBytes): RWF= 14575 Int= 0 D2E= 0 Chk= 114 Scr= 1
Normal termination of Gaussian 09 at Sat Oct 24 05:19:31 2015.

作者
Author: anmin0127 时间: 2015-10-26 09:22

sunnyyg 发表于 2015-10-26 09:09
log文件结尾是这样的：
IT MATTERS NOT HOW DEEP YOU PLOW,
BUT HOW LONG YOU STAY IN THE FURROW.

20多天？这几句话看的话是没有错误啊

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