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标题: 求助使用在线acpype（gaff和gaff2）生成乙醇的拓扑文件参数差别较大 [打印本页]

作者
Author: IamHK 时间: 2020-10-9 19:57
标题: 求助使用在线acpype（gaff和gaff2）生成乙醇的拓扑文件参数差别较大
各位老师，同学好我使用在线的acpype来产生乙醇的拓扑文件，分别使用了gaff和gaff2，发现得到的乙醇的拓扑文件中，氧原子和氢原子的sigma和epsilon两个参数有较大差别，数据如下：
gaff
;name bond_type    mass    charge ptype sigma       epsilon    Amb
c3    c3       0.00000  0.00000 A    3.39967e-01 4.57730e-01 ; 1.91  0.1094
hc    hc       0.00000  0.00000 A    2.64953e-01 6.56888e-02 ; 1.49  0.0157
h1    h1       0.00000  0.00000 A    2.47135e-01 6.56888e-02 ; 1.39  0.0157
oh    oh       0.00000  0.00000 A    3.06647e-01 8.80314e-01 ; 1.72  0.2104
ho    ho       0.00000  0.00000 A    0.00000e+00 0.00000e+00 ; 0.00  0.0000

gaff2
;name bond_type    mass    charge ptype sigma       epsilon    Amb
c3    c3       0.00000  0.00000 A    3.39771e-01 4.51035e-01 ; 1.91  0.1078
hc    hc       0.00000  0.00000 A    2.60018e-01 8.70272e-02 ; 1.46  0.0208
h1    h1       0.00000  0.00000 A    2.42200e-01 8.70272e-02 ; 1.36  0.0208
oh    oh       0.00000  0.00000 A    3.24287e-01 3.89112e-01 ; 1.82  0.0930
ho    ho       0.00000  0.00000 A    5.37925e-02 1.96648e-02 ; 0.30  0.0047

请问这种差别影响大吗？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-9 20:09
鉴于GAFF2还没有在文章里公开发表，为稳妥建议先用GAFF

作者
Author: IamHK 时间: 2020-10-9 20:11
好的,谢谢老师。

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