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标题: 怎样理解荧光光谱计算得到的图 [打印本页]

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Author: 香蕉酥 时间: 2020-10-10 15:52
标题: 怎样理解荧光光谱计算得到的图
本帖最后由香蕉酥于 2020-10-10 17:54 编辑

计算萘的荧光光谱：

此处是利用了文献当中的方法，只是想搞清楚得到的图的含义，后续会重新调整

方法一： 1.使用Hartree-Fock方法，选择6-31+g(d, p)基组，对基态建立的模型进行结构优化。电荷为0，自旋多重度为1，在#opt freq hf/6-31+g(d, p)条件下计算。

2.在优化好的结构上进行激发态的计算，得到多环芳烃的吸收光谱。用CIS计算跃迁能和吸收光谱，选取谐振强度f不为零、具有最大波长的单重的激发态。计算关键词是#rcis/6-31+g(d, p)，默认是计算前三个单重激发态。

3.选择想要的激发态进行结构优化。计算关键词为#optrcis=(root=n)/6-31+g(d, p)，选择第1个激发态进行构型优化。

4.再在激发态优化好的结构上进行激发态的计算，得到多环芳烃的发射光谱。关键词设置为#hf/6-31+g(d, p)。

步骤2、3得到的图在附件上传

得到的图不知道该怎样理解，是当激发波长在271.16nm时，荧光光谱的吸收峰在235.3nm，还是说当激发波长在235.3nm时，荧光吸收强度最强？怎样可以把得到的这些图与附件中的荧光光谱图结合起来，就是横坐标为波长，纵坐标为强度的图。

作者
Author: niobium 时间: 2020-10-10 17:24
看了前10个字就不想看了

作者
Author: ABetaCarw 时间: 2020-10-10 17:41

香蕉酥发表于 2020-10-10 17:33
请问是有什么问题吗？

为啥使用Hartree-Fock方法？

作者
Author: 香蕉酥 时间: 2020-10-10 17:46

ABetaCarw 发表于 2020-10-10 17:41
为啥使用Hartree-Fock方法？

这个是使用了文献当中提供的方法，我想先搞清楚这些本来图的意义，清楚之后会自己再学习

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-10 21:52
f叫振子强度不叫谐振强度

荧光吸收那是实验上的事，量化角度算的是荧光发射强度

如果满足Kasha规则，没有内/外转换等其它退激因素，荧光发射波长和强度和激发光源波长无关，因为最终都会在S1态发射。

作者
Author: indec 时间: 2020-10-11 04:05
最后两张实验谱图也不像是萘的激发和发射啊

作者
Author: 香蕉酥 时间: 2020-10-11 20:00

indec 发表于 2020-10-11 04:05
最后两张实验谱图也不像是萘的激发和发射啊

只是荧光光谱图，是其它物质的

作者
Author: GOmathchem 时间: 2020-10-11 22:52
本帖最后由 GOmathchem 于 2020-10-11 22:56 编辑

不是太懂你的问题，2张图片是一次任务算出来的吗？还是第2步1张，第3、4步一张？感觉是2个结构的荧光？
实验上，发射的频率一般小于吸收的频率，各种非辐射跃迁导致。

作者
Author: 香蕉酥 时间: 2020-10-12 09:28

GOmathchem 发表于 2020-10-11 22:52
不是太懂你的问题，2张图片是一次任务算出来的吗？还是第2步1张，第3、4步一张？感觉是2个结构的荧光？
实 ...

第二步得到的结果是第一张图，第二张图是在第三步得到的out文件中打开的uv-vis图。我也不怎么清楚这些图究竟是什么含义，所以才向大家求助一下。
另外您说的发射的频率一般小于吸收的频率，是否可以说发射的波长大于吸收峰值的波长？对于这两幅图的含义是否就像我题目中描述的那样呢？感谢解答

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-10-12 10:00

香蕉酥发表于 2020-10-12 09:28
第二步得到的结果是第一张图，第二张图是在第三步得到的out文件中打开的uv-vis图。我也不怎么清楚这些图 ...

sob老师已经说得很明白了

作者
Author: 香蕉酥 时间: 2020-10-12 11:08

sobereva 发表于 2020-10-10 21:52
f叫振子强度不叫谐振强度

荧光吸收那是实验上的事，量化角度算的是荧光发射强度

老师我不是很明白您的意思，在满足kasha规则下，荧光发射波长与强度和激发光源波长无关。
1.我了解到的是振子强度越大，跃迁的可能性越大，是否可以说当发射波长为235.3nm，该物质的发射强度最强？
2.另外这两幅图是不是不能结合起来，是否可以把他们命名为吸收光谱和发射光谱呢？
感谢老师的解答，我这方面的基础实在是很差，有错误的地方希望老师可以帮忙指正，谢谢老师！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-13 06:34

香蕉酥发表于 2020-10-12 11:08
老师我不是很明白您的意思，在满足kasha规则下，荧光发射波长与强度和激发光源波长无关。
1.我了解到的 ...

1 光是根据你当前计算数据可以这么说
2 我不知道你具体指哪两幅图
1L的图1可以当吸收光谱，图2不能当荧光发射光谱，你都没去掉S1以外的态的振子强度。怎么绘制这里说了
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314（http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html）

作者
Author: 香蕉酥 时间: 2020-10-13 10:34

sobereva 发表于 2020-10-13 06:34
1 光是根据你当前计算数据可以这么说
2 我不知道你具体指哪两幅图
1L的图1可以当吸收光谱，图2不能当荧 ...

明白了，谢谢老师

作者
Author: 晓来雨过 时间: 2020-10-13 12:40
“当激发波长在271.16nm时，荧光光谱的吸收峰在235.3nm，还是说当激发波长在235.3nm时，荧光吸收强度最强”，从我做实验的角度来看，最大吸收通常是最佳激发的波长。还有，测试的时候还需要注意是否存在波长依赖的特性，这个并不是所有材料都具备的。

作者
Author: lao7 时间: 2020-11-18 21:34

晓来雨过发表于 2020-10-13 12:40
“当激发波长在271.16nm时，荧光光谱的吸收峰在235.3nm，还是说当激发波长在235.3nm时，荧光吸收强度最强” ...

先不说你计算问题，你都没有把自己实验问题介绍清楚。
“当激发波长在271.16nm时，荧光光谱的吸收峰在235.3nm”，这在实验上，是不可能发生的事情。

作者
Author: 晓来雨过 时间: 2020-11-19 09:57

lao7 发表于 2020-11-18 21:34
先不说你计算问题，你都没有把自己实验问题介绍清楚。
“当激发波长在271.16nm时，荧光光谱的吸收峰在23 ...

首先，抱歉老师，我复制他的文字的时候，还想着这个说法不对来着，是我犯迷糊了。

作者
Author: 非初言 时间: 2023-11-18 15:35

sobereva 发表于 2020-10-10 21:52
f叫振子强度不叫谐振强度

荧光吸收那是实验上的事，量化角度算的是荧光发射强度

借楼问一下卢老师，就是我可以改变光谱的横坐标吗，在跑高斯的时候居然算到了±3000nm，我该怎么操作啊，但是现在看光谱是在500-1000nm发射的

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-11-18 16:56

非初言发表于 2023-11-18 08:35
借楼问一下卢老师，就是我可以改变光谱的横坐标吗，在跑高斯的时候居然算到了±3000nm，我该怎么操作啊， ...

是横轴范围算到了3000nm，还是有的峰在3000nm出现？

作者
Author: 非初言 时间: 2023-11-18 19:15

wzkchem5 发表于 2023-11-18 16:56
是横轴范围算到了3000nm，还是有的峰在3000nm出现？

是横坐标算到那里了，请问可以设置横坐标吗

现在看都上万了

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-11-19 00:38

非初言发表于 2023-11-18 12:15
是横坐标算到那里了，请问可以设置横坐标吗现在看都上万了

导出原始数据出来用origin重新作图。GaussView本身作的图即使坐标范围合理，也不适合直接放到正规期刊文章里发表

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-19 01:26

非初言发表于 2023-11-18 15:35
借楼问一下卢老师，就是我可以改变光谱的横坐标吗，在跑高斯的时候居然算到了±3000nm，我该怎么操作啊， ...

你先看最低激发能是多少，结合体系考虑是否是靠谱的值。先保证原始数据有意义，展宽作图是之后的事

作者
Author: 非初言 时间: 2023-11-21 09:04

wzkchem5 发表于 2023-11-19 00:38
导出原始数据出来用origin重新作图。GaussView本身作的图即使坐标范围合理，也不适合直接放到正规期刊文 ...

已经导出过了，因为算的横坐标范围实在太大，导出的图很丑，而且我要的范围在高斯的数据里只有几个点了

作者
Author: 非初言 时间: 2023-11-21 09:05

sobereva 发表于 2023-11-19 01:26
你先看最低激发能是多少，结合体系考虑是否是靠谱的值。先保证原始数据有意义，展宽作图是之后的事

好的，老师

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-11-21 17:48

非初言发表于 2023-11-21 02:04
已经导出过了，因为算的横坐标范围实在太大，导出的图很丑，而且我要的范围在高斯的数据里只有几个点了

不是导出图，是导出数据
有原始的x、y坐标数据了以后，再用Origin作图，x轴范围想取多大取多大

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