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标题: 使用Multiwfn做RDG散点图分析激发态分子内氢键,如何得到尖峰戳到底的横轴数值问题 [打印本页]

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清清月    时间: 2020-10-11 17:34
标题: 使用Multiwfn做RDG散点图分析激发态分子内氢键,如何得到尖峰戳到底的横轴数值问题
请问如何得到蓝色尖峰戳到底所对应的横轴具体数值?

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sobereva    时间: 2020-10-11 18:22
戳到底的spike的横坐标位置对应AIM分析的相应BCP的电子密度。因此做AIM拓扑分析,找到相应的临界点,查看其电子密度就完了,做法看
使用Multiwfn做拓扑分析以及计算孤对电子角度
http://sobereva.com/108

顺带一提,BCP位置还可以和RDG等值面图绘制在一起,这里演示了:
使用Multiwfn做NCI分析展现分子内和分子间弱相互作用
https://www.bilibili.com/video/av71561024
下文里也有这种结合展示的图
全面探究18碳环独特的分子间相互作用与pi-pi堆积特征
http://sobereva.com/572http://bbs.keinsci.com/thread-19660-1-1.html
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清清月    时间: 2020-10-24 17:01
sobereva 发表于 2020-10-11 18:22
戳到底的spike的横坐标位置对应AIM分析的相应BCP的电子密度。因此做AIM拓扑分析,找到相应的临界点,查看其 ...

已经能够找到了 感谢
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JIN957    时间: 2022-6-27 15:31
清清月 发表于 2020-10-24 17:01
已经能够找到了 感谢

您好,请问是看哪个数值,是Sign(lambda2)*rho吗,还是Reduced density gradient (RDG)?

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sobereva    时间: 2022-7-4 02:38
JIN957 发表于 2022-6-27 15:31
您好,请问是看哪个数值,是Sign(lambda2)*rho吗,还是Reduced density gradient (RDG)?

Sign(lambda2)*rho是横坐标,当然看Sign(lambda2)*rho




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