计算化学公社
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求助:reaxff力场文件中的X原子指的是什么原子,lammps中电场和reaxff兼容吗?
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作者Author:
ggshining
时间:
2020-10-14 16:37
标题:
求助:reaxff力场文件中的X原子指的是什么原子,lammps中电场和reaxff兼容吗?
本帖最后由 ggshining 于 2020-10-14 16:38 编辑
本人想做质子传递相关的分子动力学模拟,质子传递时涉及成键和断键过程,故想用reaxff力场做(用lammps)。刚开始接触reaxff反应力场,看到
van Duin
的几篇文章中用了reaxff模拟水中质子的性质:
J. Phys. Chem. B
2017, 121, 24, 6021–6032;
J. Phys. Chem. Lett.
2018, 9, 18, 5445–5452;
J. Phys. Chem. B
2018, 122, 14, 4083–4092,查看力场文件时发现原子种类中有X原子,如图
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我想知道X原子代表的是什么?请各位大佬赐教! 此外,我看到费米科技网站中说ADF中的reaxff不能加电场,因为加电场后原子跨越Cell边界的时候,会出现EEM电荷计算得到非物理的大值而报错停止,那lammps是否也有这个问题呢,或者说reaxff和电场是否兼容,会不会导致不正确的结果?
作者Author:
413
时间:
2020-10-14 19:25
X原子就是non-sense的原子,不用管。
作者Author:
mengxiangidea
时间:
2022-6-11 22:18
可以用电场命令的,我见过开发reaxff力场的用电场,更有一区二区在用电场命令结合reaxff
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