计算化学公社

标题: 因为停电还有死机，高斯终止。 [打印本页]

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Author: 一只耳 时间: 2015-10-28 11:48
标题: 因为停电还有死机，高斯终止。
学校停电，加上电脑犯抽风，做一个scan运算，中途停止了。点击CHK文件就出现错误restart之后也是从头开始，不能继续。。。2个月心血白费了，十分痛苦。。。想问问还有没有补救措施。
#p opt=modredundant b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity EmpiricalDispersion=GD3

restart的时候用的#p opt=（restart，modredundant） b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity EmpiricalDispersion=GD3

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Author: 978142355 时间: 2015-10-28 12:33
本帖最后由 978142355 于 2015-10-28 12:41 编辑

可以的，试一试（我自己做的刚性扫描）。你的命令可以改为#p opt=（restart，modredundant） b3lyp/6-31g(d) geom=allcheck guess=read EmpiricalDispersion=GD3，试一试。我需要强调的是第二张照片，除了那两行命令外，其余什么也不要加，它的意思就是要读取chk。如果你的chk没了的话，sorry，重做吧。具体见总结见http://www.gaussian.com/g_blog/faq2.htm

作者
Author: 978142355 时间: 2015-10-28 12:44
我不知道怎么回事，明明是按照1,2,3,4的顺序整的，发布的时候怎么变成这样了，你按照1,2,3,4的顺序看。sob老师，明明按照次序编排的，怎么发布变顺序了？

作者
Author: 一只耳 时间: 2015-10-28 12:58

978142355 发表于 2015-10-28 12:33
可以的，试一试（我自己做的刚性扫描）。你的命令可以改为#p opt=（restart，modredundant） b3lyp/6-31g(d ...

谢谢您的答案，
我想再请问一下，比如我要scan一百个结构，在64时停止了，按照你的方法继续的话，log文件里还会保留之前算好的64个结构吗？
怎么办才能知道restart是否成功呢？
十分感谢

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2015-10-28 13:51

一只耳发表于 2015-10-28 12:58
谢谢您的答案，
我想再请问一下，比如我要scan一百个结构，在64时停止了，按照你的方法继续的话，log文 ...

实在不行也可以看看log里面最后一个成功的scan到parameter的第几个值了，写一个新的输入，哪些值没算算哪些。

以及scan和opt=modredundant我还是倾向于写个脚本，比如有50个待扫描结构，就写个脚本让它生成50个输入文件。这样至少并行效率100%，而且restart很容易。╮(╯▽╰)╭

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Author: sobereva 时间: 2015-10-28 18:00

978142355 发表于 2015-10-28 12:44
我不知道怎么回事，明明是按照1,2,3,4的顺序整的，发布的时候怎么变成这样了，你按照1,2,3,4的顺序看。sob ...

发图时候最好不要选择上传附件，而是应该选择上传图片，传上去之后，点击图片名字把图插入到帖子相应位置，就不会有你说的问题。置顶的新人必读介绍了操作。

作者
Author: 978142355 时间: 2015-10-28 18:57

sobereva 发表于 2015-10-28 18:00
发图时候最好不要选择上传附件，而是应该选择上传图片，传上去之后，点击图片名字把图插入到帖子相应位置 ...

哦，这样啊，以前读过，第一回发给忘了。。。。。。以后注意。

作者
Author: 978142355 时间: 2015-10-28 19:04

一只耳发表于 2015-10-28 12:58
谢谢您的答案，
我想再请问一下，比如我要scan一百个结构，在64时停止了，按照你的方法继续的话，log文 ...

这个是不会保留的，因为是接着从第64歩开始的。我有个想法。你把前64歩的复制粘贴到新算的log文件中，或者把两次的能量数据copy出来，做个图。感觉应该会有更好的方法，我也学习学习。或者按照5楼Li老师的说法弄一弄也好。

作者
Author: 一只耳 时间: 2015-10-29 09:58

liyuanhe211 发表于 2015-10-28 13:51
实在不行也可以看看log里面最后一个成功的scan到parameter的第几个值了，写一个新的输入，哪些值没算算哪 ...

谢谢您的答案。
编脚本白痴一个，完全不会。。。。
还是接着算吧。

作者
Author: hcxytpp@163.com 时间: 2015-10-31 08:47

978142355 发表于 2015-10-28 12:33
可以的，试一试（我自己做的刚性扫描）。你的命令可以改为#p opt=（restart，modredundant） b3lyp/6-31g(d ...

为何您的chk文件可以放在桌面呢？

作者
Author: 978142355 时间: 2015-10-31 12:38
本帖最后由 978142355 于 2015-10-31 12:40 编辑

hcxytpp@163.com 发表于 2015-10-31 08:47
为何您的chk文件可以放在桌面呢？

windows 7系统以后都可以放在桌面上的，以前的windows XP肯定是不行。但是windows 7系统虽然可以放桌面，前提其路径上别有中文字符。

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