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标题: 气相中带净电荷液滴在电场下体系整体平移问题 [打印本页]

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Author: 961106 时间: 2020-10-15 11:36
标题: 气相中带净电荷液滴在电场下体系整体平移问题
请问老师们，做了一个气相中带净电荷液滴的体系，发现加了一个x正方向的恒定电压0.7v以后，液滴在模拟的时候一直往x反方向整体平移，参考了老师在群里让我消除平动的建议，我试了在mdp文件里消除平动comm-mode = Linear ; comm-grps = System 发现体系还是整体平移了。。。请问老师，这是因为什么呢？谢谢老师！

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-15 11:40
加上nstcomm=1再试

作者
Author: 961106 时间: 2020-10-15 15:33

sobereva 发表于 2020-10-15 11:40
加上nstcomm=1再试

谢谢老师，我加了，可是还是整体平移了。

作者
Author: 961106 时间: 2020-10-16 10:27
本帖最后由 961106 于 2020-10-16 10:29 编辑

sobereva 发表于 2020-10-15 11:40
加上nstcomm=1再试

老师，这是我最初的mdp文件，后面还加上了comm-mode = Linear ; comm-grps = System；nstcomm=1请问老师，这个参数设置有问题吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-17 14:20
用了pbc，却用简单截断方式算非键作用，cutoff还那么大，非常莫名其妙
没事甭用all-bonds
当前情况明显不适合用enerpres
没有平衡的体系不要用Nose-Hoover热浴

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