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标题: 高分子多链聚合物不同的系综的选择问题 [打印本页]

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2020-10-15 17:14
标题: 高分子多链聚合物不同的系综的选择问题
自己的情况：做的是高分子多链聚合物的溶解。1.在文献中，对于同一种溶剂，有使用nvt系综的有使用npt系综，我对于这两个系综的理解是，前者是恒温恒体积，封闭的体系，后者是恒温恒压，两者都可与外界发生能量的交换。npt系综与实际的情况更贴切。自己在计算的时候，采用了npt系综，模拟的时间达到了好几百纳秒，但是依旧没有达到溶解分散的状况。我曾经尝试了下nvt，聚合物链分散的效果不如npt系综，请问老师npt系综还有什么更高级的设置吗？或者老师们在做溶解的时候有什么更好的设置
2.我想了解以下温度在模拟的时候的设置，有时候同一体系下，高温可以和达到很快的分散溶解，较低的温度反而达到相同的效果需要更长的效果，我想请教一下温度在模拟的时候处于的作用以及它和达到相同效果的模拟时间有关系吗？
请问老师有这方面的资料或者文章推荐吗？
npt系综的设置：
integrator             = md
dt                      = 0.002
nsteps                = 500000000

nstxout                = 500
nstvout                = 500
nstlog                = 500
nstenergy             = 500
nstxout-compressed    = 500
compressed-x-grps       = DMLN  LOL
energygrps             = DMLN  LOL
cutoff-scheme          = Verlet
nstlist                = 10
ns-type                = grid
rlist                   = 1.2
coulombtype             = PME
pme_order             = 4
fourierspacing          = 0.16
rcoulomb                = 1.2
rvdw                   = 1.2
vdw-modifier          = force-switch

tcoupl                = V-rescale
tc-grps                = DMLN LOL
tau-t                   = 0.1  0.1
ref-t                   = 300.15  300.15
Pcoupl                = Berendsen
tau-p                   = 2.0
compressibility       = 4.5e-5
ref-p                   = 1.0
gen-vel                = no
gen-temp                = 300.15
gen-seed                = -1

constraints             = h-bonds
constraint-algorithm    = LINCS
lincs_iter             = 1
lincs_order             = 4

pbc                   = xyz

DispCorr                = no

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-16 01:56
1 没有什么“高级的设置”
2 高温下热运动快，自然分散溶解也容易，利用高温往往可以用较短的时间跑出低温下长得多的时间尺度的现象

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2020-10-16 20:08

sobereva 发表于 2020-10-16 01:56
1 没有什么“高级的设置”
2 高温下热运动快，自然分散溶解也容易，利用高温往往可以用较短的时间跑出低温 ...

1老师请问做溶解一般还有什么设置或者其他的吗？我这按着文献中进行的设置
2那老师这种关系有推荐的文献吗？时间和温度怎么转化？
3单独进行聚合物的模拟的时候，在高温下也会分散的，那加了溶剂还能说明问题吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-17 14:28

努力向上的boy 发表于 2020-10-16 20:08
1老师请问做溶解一般还有什么设置或者其他的吗？我这按着文献中进行的设置
2那老师这种关系有推荐的文献 ...

没有什么额外设置
出现现象的模拟时间和模拟温度之间没有明确的关系
对于单独聚合物，我不知道什么叫分散。本来你就是模拟溶剂中的溶解

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2020-10-17 16:49

sobereva 发表于 2020-10-17 14:28
没有什么额外设置
出现现象的模拟时间和模拟温度之间没有明确的关系
对于单独聚合物，我不知道什么叫分 ...

我这个聚合物由很多链密集堆砌合成，在高温下，链会分散的很远，就像溶解了一样

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-18 06:47

努力向上的boy 发表于 2020-10-17 16:49
我这个聚合物由很多链密集堆砌合成，在高温下，链会分散的很远，就像溶解了一样

溶剂肯定会显著影响溶解行为。怎么跑看实际研究的问题

作者
Author: 努力向上的boy 时间: 2020-10-18 18:26

sobereva 发表于 2020-10-18 06:47
溶剂肯定会显著影响溶解行为。怎么跑看实际研究的问题

我实际研究的问题就是让聚合物在溶剂下由聚集体到分散开，然而现在的条件达不到这样的效果，在高温下可以达到效果，按着实际条件没有达到效果。但是没有溶剂在高温下的条件下，聚集体也会分散。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-19 04:02

努力向上的boy 发表于 2020-10-18 18:26
我实际研究的问题就是让聚合物在溶剂下由聚集体到分散开，然而现在的条件达不到这样的效果，在高温下可以 ...

溶剂是必须有的，否则就算模拟出了现象也没意义。
溶剂会阻碍聚合物的运动，可能导致分散现象减慢，而且溶剂下还可能有明显疏水效应，从自由能角度也可能不利于分散。

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