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标题: 求助外重组能计算公式中的R [打印本页]

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Author: 哎呀妈呀 时间: 2020-10-18 16:59
标题: 求助外重组能计算公式中的R
请问：外重组能计算公式中的R，是分子几何中心？还是质心？[attach]29350[/attach]

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Author: wzkchem5 时间: 2020-10-18 18:19
我看到一篇文章用的是donor和acceptor半径之和，而donor和acceptor半径是用高斯的volume关键字算donor和acceptor的体积，再按球体积公式换算成有效球半径。
DOI: 10.1021/jacs.7b08902

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Author: 哎呀妈呀 时间: 2020-10-18 18:42

wzkchem5 发表于 2020-10-18 18:19
我看到一篇文章用的是donor和acceptor半径之和，而donor和acceptor半径是用高斯的volume关键字算donor和acc ...

我也是利用刚刚您提到的方法计算donor和acceptor半径，我看了两篇文章（附件）：对于R，只说了给受体的中心间距，并没有说清楚是质心还是几何中心。
我先看一下您发的文章，谢谢

作者
Author: wzkchem5 时间: 2020-10-18 20:24

哎呀妈呀发表于 2020-10-18 18:42
我也是利用刚刚您提到的方法计算donor和acceptor半径，我看了两篇文章（附件）：对于R，只说了给受体的中 ...

如果按我说的方法计算donor和acceptor半径，就不需要纠结算R是以什么点为基准了，因为这个公式是把两个分子近似为球，而且认为两个球刚好接触的时候发生电子转移，所以R总是等于两个半径之和。这样最大的好处是你不需要优化donor-acceptor复合物，只需要分别计算两者的volume就行了

作者
Author: 哎呀妈呀 时间: 2020-10-19 10:39

wzkchem5 发表于 2020-10-18 20:24
如果按我说的方法计算donor和acceptor半径，就不需要纠结算R是以什么点为基准了，因为这个公式是把两个分 ...

好的，已经计算了，谢谢您

作者
Author: sobereva 时间: 2020-10-21 03:47
相关信息看
谈谈分子半径的计算和分子形状的描述
http://sobereva.com/190
乱谈外重组能的计算
http://sobereva.com/333

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