计算化学公社
标题:
packmol中fixed命令无法将分子固定在特定的位置
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作者Author:
lining
时间:
2020-10-20 21:23
标题:
packmol中fixed命令无法将分子固定在特定的位置
sob老师您好,我在尝试用packmol建立一个水中苯的模型,苯分子位于水盒子中央,阅读了您 构建被显式溶剂层包裹的分子的简单方法(
http://sobereva.com/406
)的博文,我使用fixed命令去构建模型,但苯分子一直出现在盒子的外部,请问您这是什么原因造成的啊?附件为水分子pdb文件、苯分子pdb文件、inp文件、packmol导出的pdb文件和模型vmd显示截图的压缩包。
作者Author:
liuyuje714
时间:
2020-10-20 22:17
12.5后面那个点不需要
作者Author:
lining
时间:
2020-10-20 22:34
liuyuje714 发表于 2020-10-20 22:17
12.5后面那个点不需要
原来如此,非常感谢您,老师!
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