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标题: packmol中fixed命令无法将分子固定在特定的位置 [打印本页]

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lining    时间: 2020-10-20 21:23
标题: packmol中fixed命令无法将分子固定在特定的位置
sob老师您好,我在尝试用packmol建立一个水中苯的模型,苯分子位于水盒子中央,阅读了您 构建被显式溶剂层包裹的分子的简单方法(http://sobereva.com/406)的博文,我使用fixed命令去构建模型,但苯分子一直出现在盒子的外部,请问您这是什么原因造成的啊?附件为水分子pdb文件、苯分子pdb文件、inp文件、packmol导出的pdb文件和模型vmd显示截图的压缩包。

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liuyuje714    时间: 2020-10-20 22:17
12.5后面那个点不需要
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lining    时间: 2020-10-20 22:34
liuyuje714 发表于 2020-10-20 22:17
12.5后面那个点不需要

原来如此,非常感谢您,老师!




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